More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
382 aa  749    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2258  peptidase M24  74.12 
 
 
376 aa  472  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000254191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  61.29 
 
 
380 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  61.29 
 
 
380 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  61.29 
 
 
380 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  61.78 
 
 
376 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  61.89 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  61.21 
 
 
375 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  59.79 
 
 
371 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  59.29 
 
 
383 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  60.23 
 
 
369 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  58.68 
 
 
361 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  57.37 
 
 
384 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  61.41 
 
 
371 aa  378  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  58.97 
 
 
374 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  59.35 
 
 
374 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  57.57 
 
 
386 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  58.72 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  45.65 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  45.14 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  45.3 
 
 
384 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  41.76 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  49.31 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0720  peptidase M24  43.98 
 
 
373 aa  237  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  43.26 
 
 
397 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  41.44 
 
 
366 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  41.46 
 
 
367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  43.72 
 
 
373 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  39.63 
 
 
371 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  33.7 
 
 
351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  36.22 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  35.85 
 
 
362 aa  209  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  38.08 
 
 
366 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  33.33 
 
 
357 aa  205  8e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  38.69 
 
 
376 aa  202  8e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  37.77 
 
 
371 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  35.57 
 
 
366 aa  193  5e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  34.52 
 
 
353 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  34.25 
 
 
353 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  34.25 
 
 
353 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  34.25 
 
 
353 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  39.08 
 
 
448 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  34.25 
 
 
353 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  33.97 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  34.25 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  34.52 
 
 
353 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  42.04 
 
 
353 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  35.58 
 
 
368 aa  187  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  41.63 
 
 
353 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  32.98 
 
 
369 aa  187  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  39.69 
 
 
353 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  33.96 
 
 
364 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  36.51 
 
 
372 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  41.77 
 
 
357 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  37.16 
 
 
358 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  34.05 
 
 
361 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  35.28 
 
 
403 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  39.31 
 
 
353 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  33.16 
 
 
405 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  33.6 
 
 
359 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  35.31 
 
 
381 aa  180  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  34.58 
 
 
365 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  34.58 
 
 
365 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  34.32 
 
 
365 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  34.58 
 
 
365 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  34.32 
 
 
365 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  35.37 
 
 
364 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  34.32 
 
 
365 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  31.49 
 
 
353 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  34.32 
 
 
365 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  33.78 
 
 
365 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  34.86 
 
 
414 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  34.32 
 
 
365 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  32.34 
 
 
361 aa  176  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  40.43 
 
 
359 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  33.97 
 
 
365 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0189  peptidase M24  31.42 
 
 
351 aa  176  7e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0275902  normal  0.05907 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  40.85 
 
 
359 aa  175  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  32.89 
 
 
412 aa  176  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  34.06 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  33.06 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  32.15 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  40.98 
 
 
353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  42.92 
 
 
364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  34.71 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  33.06 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  31.42 
 
 
356 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  45.34 
 
 
354 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  33.52 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  33.78 
 
 
365 aa  172  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  29.73 
 
 
356 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  32.09 
 
 
405 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  32.15 
 
 
357 aa  169  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  30.6 
 
 
358 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  29.19 
 
 
356 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  36.5 
 
 
356 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  29.19 
 
 
356 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  31.77 
 
 
351 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  40.71 
 
 
346 aa  167  2e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  38.21 
 
 
356 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>