More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6059 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  100 
 
 		 379 aa  781    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  65.33 
 
 		 378 aa  527  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  32.92 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0666  peptidase M24  29.7 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  28.14 
 
 		 357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.01 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  27.42 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  24.61 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  26.72 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.54 
 
 		 348 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.02 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  26.05 
 
 		 392 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.33 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  24.47 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  27.69 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  25.4 
 
 		 356 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  25.69 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4994  peptidase M24  27.98 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  27.45 
 
 		 359 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  25.33 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.78 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  25.33 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  25.48 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  32.31 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  27.07 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2365  peptidase M24  26.29 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.78 
 
 		 365 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  25.2 
 
 		 378 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.44 
 
 		 365 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.12 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.78 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.09 
 
 		 365 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.44 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  27 
 
 		 356 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.78 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.78 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  26.9 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.39 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  25.63 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.44 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.78 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25.14 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  22.9 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  27.48 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  26.58 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  22.9 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  25 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  25 
 
 		 351 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  26.98 
 
 		 383 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  29.5 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  29.14 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  29.5 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  29.14 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  26.67 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  25.61 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  27.54 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  29.14 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  29.14 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  29.14 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  29.14 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  29.14 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  25.42 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  29.14 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  26.48 
 
 		 392 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.65 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  26.68 
 
 		 356 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  25.47 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.48 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  26.32 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  25.27 
 
 		 419 aa  99.8  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.7 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  23.74 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  30.39 
 
 		 376 aa  99.4  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24.93 
 
 		 353 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.4 
 
 		 384 aa  99.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  27.39 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24.93 
 
 		 353 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  26.39 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  29.17 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  26.11 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0663  peptidase M24  27.85 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  26.26 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  26.6 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  26.11 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  24.31 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  28.42 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  24.34 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  28.08 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  26.11 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  26.11 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  29.76 
 
 		 449 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  24.73 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  25 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  26.11 
 
 		 361 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  30.57 
 
 		 362 aa  96.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  26.37 
 
 		 361 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  26.42 
 
 		 387 aa  96.3  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  27.78 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  22.85 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  25.27 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>