More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0461 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  100 
 
 
419 aa  869    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  70.44 
 
 
418 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  68.15 
 
 
403 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3667  creatinase  67.16 
 
 
403 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  66.91 
 
 
403 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  66.91 
 
 
403 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  66.91 
 
 
403 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  65.77 
 
 
418 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1692  creatinase  64.69 
 
 
408 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  64.44 
 
 
409 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  66.75 
 
 
403 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  63.08 
 
 
410 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1018  creatinase  62.37 
 
 
404 aa  501  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  62.66 
 
 
379 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  57.61 
 
 
402 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  57.71 
 
 
401 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  57.96 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  56.97 
 
 
401 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  56.74 
 
 
386 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  27.2 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.4 
 
 
365 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  26.4 
 
 
365 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  26.4 
 
 
365 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.4 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  26.4 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  26.4 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  26.4 
 
 
365 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  26.13 
 
 
365 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  26.13 
 
 
365 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.87 
 
 
365 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  26.33 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  28.78 
 
 
380 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  26.65 
 
 
361 aa  111  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  27.18 
 
 
391 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  30.03 
 
 
353 aa  109  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  27.71 
 
 
392 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  25.07 
 
 
364 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  27.64 
 
 
388 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  26.49 
 
 
347 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  26.21 
 
 
381 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  28.88 
 
 
353 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  28.43 
 
 
388 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  26.7 
 
 
392 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  28.68 
 
 
388 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  25.99 
 
 
356 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.96 
 
 
347 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  26.4 
 
 
393 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  27.08 
 
 
353 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.67 
 
 
357 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.23 
 
 
353 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  26.3 
 
 
356 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  29.5 
 
 
356 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  28.21 
 
 
400 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  25.99 
 
 
356 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  26.56 
 
 
355 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.23 
 
 
353 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.23 
 
 
353 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.23 
 
 
353 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.49 
 
 
353 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  29.14 
 
 
356 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.23 
 
 
353 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  25.27 
 
 
379 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  25.73 
 
 
356 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  28.99 
 
 
356 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.23 
 
 
353 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  28.99 
 
 
356 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  27.53 
 
 
346 aa  99  1e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  28.99 
 
 
356 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.23 
 
 
353 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  26.95 
 
 
351 aa  99  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  26.29 
 
 
369 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.01 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  25.49 
 
 
387 aa  99  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.96 
 
 
353 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  28.99 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  27.93 
 
 
355 aa  97.1  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  25.99 
 
 
369 aa  97.1  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  29.35 
 
 
354 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  28.62 
 
 
356 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  25.98 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  25.21 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  26.58 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.4 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  25.73 
 
 
359 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  25.55 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  26.34 
 
 
357 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  24.41 
 
 
364 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  27.7 
 
 
356 aa  93.6  7e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  24.54 
 
 
360 aa  93.6  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  25.98 
 
 
351 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  25.98 
 
 
351 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  26.43 
 
 
348 aa  92.8  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  26.29 
 
 
355 aa  93.2  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  26.6 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  27.32 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  24.07 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  26.06 
 
 
361 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  28.3 
 
 
448 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  26.6 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  25.27 
 
 
362 aa  90.1  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>