More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1692 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1692  creatinase  100 
 
 		 408 aa  849    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  99.02 
 
 		 409 aa  840    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  66.5 
 
 		 403 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  64.69 
 
 		 419 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  63.96 
 
 		 403 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3667  creatinase  63.2 
 
 		 403 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1018  creatinase  66.24 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  63.36 
 
 		 403 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  63.1 
 
 		 403 aa  534  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  62.69 
 
 		 403 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  66.67 
 
 		 379 aa  531  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  65.31 
 
 		 410 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  57.54 
 
 		 418 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  57.43 
 
 		 418 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  57.07 
 
 		 386 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  55.64 
 
 		 402 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  56.36 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  55.64 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  55.13 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.6 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.15 
 
 		 347 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.6 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.6 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.6 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  25.52 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.6 
 
 		 365 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  26.91 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.33 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  26.77 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.33 
 
 		 365 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.27 
 
 		 365 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.33 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.33 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.33 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  25.91 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  26.53 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.59 
 
 		 353 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.15 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.15 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  26.29 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  25.49 
 
 		 394 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.15 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.58 
 
 		 353 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  24.81 
 
 		 381 aa  90.5  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.15 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.15 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.15 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  25.86 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.89 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4362  peptidase M24  27.79 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000064501  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  27.47 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  26.26 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  25 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  27.66 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.83 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  31.25 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  29.88 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  24.61 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  27.56 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  30 
 
 		 400 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  27.05 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  23.67 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  24.39 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  26.27 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  24.8 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  25.33 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  27.12 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  27.27 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  22.86 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.91 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1315  Xaa-Pro dipeptidase (cobalt-dependent)  24.32 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  25.77 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  24.48 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  26.76 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  24.86 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1890  proline dipeptidase  24.81 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  25.86 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  23 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  22.75 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.7 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  23.39 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  26.86 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  23.35 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  24.87 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  26.72 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  26.44 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.22 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  24.53 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  25.52 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  25.52 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  23.68 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  22.5 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  25.52 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.36 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  23.16 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  23.64 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  25.16 
 
 		 357 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  25.21 
 
 		 355 aa  72  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  25.44 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>