More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3667 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3667  creatinase  100 
 
 		 403 aa  843    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  99.5 
 
 		 403 aa  839    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  93.05 
 
 		 403 aa  795    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  98.26 
 
 		 403 aa  829    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  85.61 
 
 		 403 aa  749    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  70.82 
 
 		 403 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  67.16 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1692  creatinase  63.2 
 
 		 408 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  63.2 
 
 		 409 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  61.14 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1018  creatinase  61.6 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  62.69 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  59.51 
 
 		 418 aa  508  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  63.13 
 
 		 379 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  58.29 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  57.86 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  58.35 
 
 		 401 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  58.75 
 
 		 386 aa  481  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  57.11 
 
 		 401 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.73 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.46 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.46 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.46 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.26 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.86 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.46 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.46 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.19 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  27.99 
 
 		 380 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  26.15 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.72 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  25.69 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.19 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.3 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.19 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  27.11 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  25.7 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  24.06 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.68 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  25.5 
 
 		 361 aa  99.8  7e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.68 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.68 
 
 		 353 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  25.75 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.41 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.41 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  26.8 
 
 		 448 aa  96.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.41 
 
 		 353 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.41 
 
 		 353 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.41 
 
 		 353 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.41 
 
 		 353 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.07 
 
 		 364 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  25.98 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  24.49 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.41 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  24.68 
 
 		 393 aa  94  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  27.27 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  24.32 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  25.91 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.86 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.06 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  24.26 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  23.94 
 
 		 392 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.83 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  25.89 
 
 		 356 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  23.57 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  24.86 
 
 		 353 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.37 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.44 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.44 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  24.26 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  23.72 
 
 		 369 aa  88.2  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  28.1 
 
 		 348 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  23.37 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  24.87 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  23.06 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  26.02 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  26.83 
 
 		 357 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  25.55 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  23.56 
 
 		 359 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  24.18 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  26.29 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  23.37 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  25.26 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  22.16 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  23.29 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  23.4 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  24 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  27.6 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  25.7 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  23.25 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.47 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.47 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.47 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  27.2 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  27.2 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  25.07 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  27.2 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  27.2 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  25.26 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  25.19 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>