More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4077 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  100 
 
 
388 aa  802    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  97.16 
 
 
388 aa  785    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  79.38 
 
 
388 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  56.81 
 
 
393 aa  462  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  57.18 
 
 
393 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1829  peptidase M24  43.46 
 
 
385 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2710  peptidase M24  44.03 
 
 
387 aa  295  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529635  normal  0.905643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.57 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.57 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  35.68 
 
 
357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  30.1 
 
 
386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  29.97 
 
 
356 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  29.44 
 
 
356 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  27.99 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  29.49 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  27.99 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30.61 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  28.87 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  28.25 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.31 
 
 
380 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  28.08 
 
 
356 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  28.53 
 
 
359 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  28.08 
 
 
356 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  26 
 
 
397 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  28.08 
 
 
356 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  29.59 
 
 
367 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  29.18 
 
 
356 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  28.08 
 
 
356 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  28.91 
 
 
356 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  28.23 
 
 
353 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  28.91 
 
 
356 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.44 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  28.3 
 
 
373 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  27.03 
 
 
372 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.75 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  28.11 
 
 
365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.66 
 
 
384 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  30.97 
 
 
346 aa  119  9e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  28.38 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  28.5 
 
 
366 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  28.38 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.53 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  28.11 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  28.11 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  26.76 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  28.11 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  29.58 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  32.64 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  25.91 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  28.11 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  28.11 
 
 
365 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.37 
 
 
353 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.91 
 
 
353 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.64 
 
 
353 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  27.84 
 
 
365 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  27.95 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  28.27 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  27.7 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  25.31 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  31.99 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  28.18 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.91 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  29.1 
 
 
345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.91 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.91 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  28.39 
 
 
412 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  32.3 
 
 
354 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  28.07 
 
 
353 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  28.07 
 
 
353 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.91 
 
 
353 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.91 
 
 
353 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  27.57 
 
 
365 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  29.81 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  29.09 
 
 
448 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.64 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  30.86 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  26.01 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  27.11 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  32.77 
 
 
361 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  32.77 
 
 
361 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  27.42 
 
 
405 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  32.75 
 
 
361 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  33.19 
 
 
361 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  33.19 
 
 
361 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  33.19 
 
 
361 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  26.7 
 
 
369 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7500  peptidase M24  25.63 
 
 
398 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137985  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  29.67 
 
 
357 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  25.55 
 
 
357 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  26.11 
 
 
394 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  31.32 
 
 
388 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.92 
 
 
356 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  27.89 
 
 
365 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  31.92 
 
 
355 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  27.11 
 
 
404 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  31.34 
 
 
354 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  31.93 
 
 
361 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  27.76 
 
 
361 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  28.85 
 
 
382 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  27.15 
 
 
359 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>