More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1765 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  80.86 
 
 
397 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  100 
 
 
397 aa  820    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  44.85 
 
 
397 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  45.65 
 
 
397 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  40.26 
 
 
400 aa  338  9e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  43.33 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  43.04 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  44.05 
 
 
402 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  42.03 
 
 
396 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  41.58 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  42.31 
 
 
388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  42.82 
 
 
388 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  42.56 
 
 
389 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  42.56 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  40.51 
 
 
389 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  40.55 
 
 
396 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  39.59 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  38.56 
 
 
396 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  38.97 
 
 
390 aa  296  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  38.42 
 
 
387 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  36.27 
 
 
405 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  37.73 
 
 
385 aa  278  9e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  35.99 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  37.79 
 
 
394 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  33.68 
 
 
397 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  33.67 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  31.12 
 
 
398 aa  209  9e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  31.59 
 
 
397 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  31.84 
 
 
414 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  30.18 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  30.05 
 
 
397 aa  199  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  31.82 
 
 
407 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  30.85 
 
 
397 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  30.87 
 
 
395 aa  192  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  33.08 
 
 
399 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  29.75 
 
 
408 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  29.35 
 
 
407 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  30.05 
 
 
397 aa  186  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  29.35 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  29.67 
 
 
419 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  30.75 
 
 
398 aa  177  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  28.3 
 
 
397 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.25 
 
 
367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.34 
 
 
353 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  26 
 
 
388 aa  126  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.85 
 
 
356 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.23 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.92 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.92 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  27.08 
 
 
351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  25.25 
 
 
388 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  24.41 
 
 
347 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  23.87 
 
 
365 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  26.19 
 
 
356 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  23.87 
 
 
365 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  25.4 
 
 
356 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  24.69 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  25.4 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.87 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.87 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  25.4 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  23.87 
 
 
365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.87 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.87 
 
 
365 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  23.87 
 
 
365 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  25.66 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  26.37 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  25.4 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.62 
 
 
365 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  26.01 
 
 
356 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.62 
 
 
365 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  26.13 
 
 
348 aa  116  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  25.39 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  28.52 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.52 
 
 
353 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  28.38 
 
 
353 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  25.66 
 
 
353 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  25.66 
 
 
353 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.9 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.9 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.53 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  25.13 
 
 
356 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  25.13 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  23.37 
 
 
365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  23.62 
 
 
357 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.95 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  26.12 
 
 
384 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  26.7 
 
 
361 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  26.24 
 
 
361 aa  109  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.99 
 
 
378 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  24.69 
 
 
388 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  25.6 
 
 
347 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  25.07 
 
 
383 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  26.16 
 
 
364 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  25 
 
 
363 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>