More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2216 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  100 
 
 
397 aa  820    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  69.02 
 
 
397 aa  589  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  67.51 
 
 
397 aa  585  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  66.25 
 
 
397 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  64.89 
 
 
397 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  59.9 
 
 
399 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  59.09 
 
 
397 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  58.08 
 
 
397 aa  502  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  59.29 
 
 
398 aa  501  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  58.12 
 
 
395 aa  497  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  54.06 
 
 
399 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  49.61 
 
 
397 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  38.75 
 
 
407 aa  292  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  39.65 
 
 
414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  39.8 
 
 
419 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  36.48 
 
 
408 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  36.04 
 
 
407 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  33.51 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  35.23 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  33.68 
 
 
400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  32.54 
 
 
398 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  32.3 
 
 
398 aa  209  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  31.59 
 
 
397 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  31.85 
 
 
397 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  34.11 
 
 
387 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  33.42 
 
 
390 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  32.38 
 
 
397 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  30.53 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  31.32 
 
 
397 aa  196  7e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  31.32 
 
 
389 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  33.68 
 
 
402 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  30.56 
 
 
396 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  33.68 
 
 
405 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  33.83 
 
 
388 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  31.88 
 
 
396 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  30.73 
 
 
396 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  32.3 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  32.99 
 
 
388 aa  183  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  31.36 
 
 
396 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  32.3 
 
 
394 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  32.1 
 
 
390 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  30.31 
 
 
398 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  25.76 
 
 
360 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.69 
 
 
365 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.69 
 
 
365 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  29.69 
 
 
365 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  29.69 
 
 
365 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.65 
 
 
365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29.69 
 
 
365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29.69 
 
 
365 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  28.33 
 
 
365 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  29.35 
 
 
365 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.35 
 
 
365 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  29.35 
 
 
365 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  28.22 
 
 
346 aa  103  7e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  26.25 
 
 
356 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25.71 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  25.67 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  25.67 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  25.98 
 
 
356 aa  96.3  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  25.4 
 
 
348 aa  96.3  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.95 
 
 
347 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  27.4 
 
 
359 aa  93.6  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  25.7 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  30.8 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  23.76 
 
 
358 aa  92.8  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  27.4 
 
 
359 aa  92  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  24.8 
 
 
355 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  25.96 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  26.12 
 
 
405 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  25.46 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  27.11 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.89 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  25.62 
 
 
403 aa  90.9  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  25.76 
 
 
366 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  23.68 
 
 
353 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  27.76 
 
 
363 aa  89.4  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  23.68 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  24.55 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  22.74 
 
 
351 aa  87  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  23.14 
 
 
351 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  23.14 
 
 
351 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  24.28 
 
 
358 aa  87  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0624  peptidase/creatianse family protein  24.65 
 
 
357 aa  86.7  7e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  26.46 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  23.67 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  24.61 
 
 
358 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  27.68 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  25.44 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  24.81 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  24.75 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  24.64 
 
 
402 aa  84  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  26.53 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  25.76 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  22.28 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.38 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  24.5 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  28.46 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  23.36 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  25.63 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>