More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1651 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  100 
 
 		 396 aa  809    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  97.98 
 
 		 396 aa  769    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  63.13 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  62.72 
 
 		 397 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  61.21 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  59.09 
 
 		 396 aa  498  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  58.08 
 
 		 398 aa  488  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  48.6 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  44.47 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  43.11 
 
 		 398 aa  330  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  39.79 
 
 		 397 aa  322  8e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  41.51 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  38.56 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  37.37 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  40.43 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  39.13 
 
 		 389 aa  289  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  38.58 
 
 		 385 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  38.52 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  38.27 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  36.32 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  36.15 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  38.36 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  34.95 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  35.58 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  35.5 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  33.93 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  31.36 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  30.87 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  31.91 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  31.25 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  31.63 
 
 		 397 aa  182  7e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  28.29 
 
 		 408 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  34.18 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  33.33 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  30.33 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  29.57 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  31.61 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  31.41 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  29.52 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  31.41 
 
 		 397 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  29.7 
 
 		 414 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  28.72 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.74 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.99 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.99 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.74 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.99 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.74 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.74 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.74 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.67 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  28.28 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.48 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  27.41 
 
 		 369 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  29.49 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  26.46 
 
 		 365 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  26.21 
 
 		 365 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  26.21 
 
 		 365 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.21 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  26.21 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.21 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  26.21 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.95 
 
 		 365 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  26.08 
 
 		 365 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  26.21 
 
 		 365 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.51 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.7 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.03 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  24.74 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  27.06 
 
 		 353 aa  117  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  30.43 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  26.35 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.09 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  27.81 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  23.45 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  27.3 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  23.79 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.48 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  28.42 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.94 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.16 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.28 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  23.26 
 
 		 356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  28.19 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.28 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  27.71 
 
 		 362 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  28.29 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  23.97 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  23.97 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  28.5 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  25.49 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  24.23 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.23 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  23.35 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  26.49 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  30.9 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  27.11 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.32 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  28.02 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  27.97 
 
 		 380 aa  106  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>