More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1630 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  100 
 
 
395 aa  812    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  62.18 
 
 
397 aa  544  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  63.36 
 
 
397 aa  542  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  63.29 
 
 
398 aa  535  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  60.15 
 
 
397 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  62.4 
 
 
399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  61.07 
 
 
397 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  57.87 
 
 
397 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  59.59 
 
 
397 aa  498  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  58.12 
 
 
397 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  57.97 
 
 
399 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  46.02 
 
 
397 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  38 
 
 
407 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  38.5 
 
 
419 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  37.5 
 
 
414 aa  266  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  36.29 
 
 
407 aa  254  3e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  35.55 
 
 
408 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  35.53 
 
 
397 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  35.12 
 
 
400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  33.94 
 
 
396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  34.79 
 
 
398 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  32.5 
 
 
396 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  35.86 
 
 
405 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  32.54 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  33.33 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  31.71 
 
 
397 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  31.96 
 
 
397 aa  196  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  32.39 
 
 
385 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  32.43 
 
 
389 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  33.93 
 
 
396 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  29.16 
 
 
397 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  30.87 
 
 
397 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  33.93 
 
 
396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  31.31 
 
 
396 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  32.7 
 
 
389 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  32.55 
 
 
388 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  30.97 
 
 
390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  31.44 
 
 
390 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  31.17 
 
 
388 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  29.97 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  32.14 
 
 
398 aa  162  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  30.63 
 
 
394 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  25.99 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  29.24 
 
 
357 aa  106  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.72 
 
 
376 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  29.32 
 
 
376 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.42 
 
 
359 aa  97.1  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  26.61 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.22 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.42 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.27 
 
 
380 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  27.75 
 
 
375 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.57 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.57 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  30.3 
 
 
358 aa  93.6  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  28.07 
 
 
373 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  23.47 
 
 
358 aa  93.2  8e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  23.35 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  30.5 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  26.05 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  25.63 
 
 
351 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  26.33 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  25.63 
 
 
351 aa  90.9  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.93 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.94 
 
 
365 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  24.54 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.94 
 
 
365 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.94 
 
 
365 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  27.2 
 
 
354 aa  89.7  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  27.44 
 
 
353 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.94 
 
 
365 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.64 
 
 
347 aa  89  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  27.4 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  25.82 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  29.7 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.86 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  26.18 
 
 
356 aa  87  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.6 
 
 
365 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.6 
 
 
365 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.82 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.44 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.44 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.44 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.44 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.44 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.6 
 
 
365 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.44 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.44 
 
 
353 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  27.45 
 
 
357 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  28.15 
 
 
357 aa  86.3  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.26 
 
 
365 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  23.46 
 
 
346 aa  86.3  9e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  26.28 
 
 
365 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.14 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  23.73 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  24.56 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  23.68 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.07 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.26 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  24.01 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>