More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2836 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  96.65 
 
 		 388 aa  771    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  79.18 
 
 		 389 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  100 
 
 		 388 aa  792    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  74.29 
 
 		 389 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  64.18 
 
 		 390 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  62.11 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  52.96 
 
 		 387 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  43.59 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  42.82 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  43.81 
 
 		 398 aa  318  7.999999999999999e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  41.12 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  39.69 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  37.79 
 
 		 396 aa  275  9e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  36.95 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  39.48 
 
 		 396 aa  265  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  36.73 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  37.8 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  37.34 
 
 		 396 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  36.76 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  37.11 
 
 		 405 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  36.83 
 
 		 396 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  38.68 
 
 		 385 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  37.31 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  34.86 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  31.54 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  33.33 
 
 		 399 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  32.37 
 
 		 397 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  32.99 
 
 		 397 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  31.2 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  31.74 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  32.9 
 
 		 407 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  31.17 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  30.67 
 
 		 407 aa  176  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  31.15 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  31.47 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  32.35 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  31.25 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  31.01 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  32.46 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  30.31 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  31.36 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  32.9 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.8 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  29.43 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.24 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24.74 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24.74 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  29.29 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  26.49 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  24.74 
 
 		 353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.19 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.46 
 
 		 347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.83 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.64 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.9 
 
 		 353 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.58 
 
 		 353 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.64 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  27.47 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.64 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.64 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.64 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.64 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.09 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  25.78 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  26.18 
 
 		 354 aa  106  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.95 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  25.26 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  25.97 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  26.68 
 
 		 383 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  26.28 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  25.51 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  26.28 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  26.79 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  26.8 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  26.65 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.7 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.7 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.7 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.7 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.74 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.7 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.7 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.45 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.45 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  25.76 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  25.58 
 
 		 356 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.94 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  24.73 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  26.56 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  25.14 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  25.14 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  25.26 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  26.36 
 
 		 356 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.67 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.67 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  23.66 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  24.3 
 
 		 357 aa  99.8  7e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  25.14 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.74 
 
 		 356 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  24.74 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>