More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1989 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  100 
 
 		 407 aa  826    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  70.86 
 
 		 419 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  60.1 
 
 		 414 aa  533  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  55.5 
 
 		 407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  54.68 
 
 		 408 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  40.25 
 
 		 397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  39.59 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  38.29 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  38.75 
 
 		 397 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  41.92 
 
 		 397 aa  292  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  39.2 
 
 		 399 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  37.19 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  39.19 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  38 
 
 		 395 aa  276  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  39.3 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  35.07 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  37.13 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  35.77 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  34.64 
 
 		 396 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  34.58 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  36.01 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  35.29 
 
 		 387 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  33.6 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  34.49 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  30.6 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  31.15 
 
 		 398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  34.44 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  33 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  29.32 
 
 		 396 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  29.35 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  30.1 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  29.35 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  32 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  32.99 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  32.15 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  32.9 
 
 		 388 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  32.38 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  29.05 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  35.25 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  28.57 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  29.57 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  29.57 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0217  M24 family peptidase  31.85 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  29.26 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  31.94 
 
 		 356 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  28.74 
 
 		 356 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.72 
 
 		 376 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  28.76 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2198  peptidase M24  28.66 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  29.96 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  30.47 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  28.18 
 
 		 348 aa  94.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  28.44 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  28.16 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  25.99 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.46 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  25.99 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.85 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  25.13 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.74 
 
 		 380 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.74 
 
 		 380 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  29.51 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  29.26 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  27.13 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  28.07 
 
 		 363 aa  88.2  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.87 
 
 		 380 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  27.87 
 
 		 369 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  27.81 
 
 		 357 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  26.11 
 
 		 373 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  25.96 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  29.18 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  25.81 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  28.52 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24.08 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24.08 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.48 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  26.87 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  31.76 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  27.05 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  31.18 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  28.73 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  30.19 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2585  peptidase M24  27.22 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  31.18 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  31.18 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  31.18 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  31.18 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  31.18 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0728  Fis family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  31.18 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  31.18 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  30 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  30.59 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  31.18 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  26.72 
 
 		 361 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  27.92 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  29.8 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  29.25 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.51 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.14 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>