More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0889 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  100 
 
 
398 aa  813    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  36.39 
 
 
397 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  35.16 
 
 
400 aa  242  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  35.4 
 
 
398 aa  242  7e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  36.46 
 
 
385 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  35.59 
 
 
396 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  34 
 
 
397 aa  230  4e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  33.92 
 
 
398 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  33.83 
 
 
396 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  35.5 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  35.25 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  32.39 
 
 
397 aa  216  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  31.12 
 
 
397 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  32.65 
 
 
389 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  29.67 
 
 
397 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  32.73 
 
 
396 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  31.63 
 
 
389 aa  200  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  32.91 
 
 
405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  31.63 
 
 
388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  31.27 
 
 
387 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  31.54 
 
 
388 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  30.08 
 
 
394 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  31.06 
 
 
390 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  30.95 
 
 
419 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  32.38 
 
 
407 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  30.21 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  27.82 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  30.89 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  30.05 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  32.14 
 
 
395 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  29.27 
 
 
408 aa  160  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  30.17 
 
 
397 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  30.99 
 
 
397 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  30.31 
 
 
397 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  29.9 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  28.61 
 
 
397 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  29.07 
 
 
399 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  28.96 
 
 
397 aa  149  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  28.39 
 
 
397 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  29.35 
 
 
398 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  31.31 
 
 
399 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  29.27 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.82 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  31.29 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  29.79 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.51 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.75 
 
 
353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  26.86 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.55 
 
 
353 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  26.8 
 
 
353 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  26.8 
 
 
353 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  26.8 
 
 
353 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  26.8 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.8 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  26.49 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  26.8 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.17 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  26.23 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2198  peptidase M24  28.57 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  25.26 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  28.39 
 
 
356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  29.65 
 
 
359 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  28.13 
 
 
360 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.78 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  26.67 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  26.74 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  27.76 
 
 
357 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  24.36 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  27.39 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  25.38 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  27.3 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  25.57 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  26.68 
 
 
356 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.45 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  25.71 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0217  M24 family peptidase  29.22 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  25.72 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  27.8 
 
 
362 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  29.96 
 
 
375 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  29.23 
 
 
365 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  28.79 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  27.37 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  26.68 
 
 
356 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  28.63 
 
 
353 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  28.63 
 
 
353 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  23.08 
 
 
356 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  29.29 
 
 
362 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  25 
 
 
356 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  25.79 
 
 
348 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  27.5 
 
 
373 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  30.38 
 
 
388 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  24.09 
 
 
355 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  26.29 
 
 
374 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  27.01 
 
 
348 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  23.35 
 
 
369 aa  106  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  25.91 
 
 
359 aa  106  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  30 
 
 
353 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  25.88 
 
 
351 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  25.88 
 
 
351 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  22.31 
 
 
356 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>