More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2614 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
397 aa  813    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  64.99 
 
 
397 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  64.12 
 
 
397 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  64.38 
 
 
397 aa  558  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  64.89 
 
 
397 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  62.63 
 
 
397 aa  520  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  61.36 
 
 
399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  61.07 
 
 
395 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  61.58 
 
 
398 aa  510  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  59.85 
 
 
397 aa  509  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  56.74 
 
 
399 aa  457  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  50.88 
 
 
397 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  41.92 
 
 
407 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  41.85 
 
 
414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  41.69 
 
 
419 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  38.54 
 
 
407 aa  266  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  38.78 
 
 
408 aa  251  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  35.06 
 
 
397 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  36.56 
 
 
400 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  34.83 
 
 
398 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  33.42 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  35.58 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  32.82 
 
 
397 aa  196  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  30.85 
 
 
397 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  32.37 
 
 
396 aa  193  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  30.65 
 
 
397 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  33.94 
 
 
398 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  32.47 
 
 
385 aa  189  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  32.82 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  32.39 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  35.99 
 
 
405 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  31.41 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  33.95 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  29.82 
 
 
402 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  32.12 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  30.37 
 
 
389 aa  162  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  31.61 
 
 
396 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  32.47 
 
 
388 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  32.1 
 
 
389 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  32.9 
 
 
388 aa  159  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  30.99 
 
 
398 aa  157  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  30.05 
 
 
390 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  34.12 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  29.24 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  28.99 
 
 
348 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  28.65 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  28.7 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28 
 
 
376 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  26.84 
 
 
365 aa  90.9  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.61 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.08 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.08 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.08 
 
 
365 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.72 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.72 
 
 
380 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.08 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.17 
 
 
347 aa  87.4  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.67 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.75 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.75 
 
 
365 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  32.05 
 
 
375 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  27.51 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.57 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  27.55 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  26.74 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.42 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.42 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.75 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  29.69 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  25.84 
 
 
378 aa  84  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  26.78 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  26.9 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.16 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  26.88 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  27.14 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  27.21 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  27.96 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.27 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.67 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.97 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  26.36 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  25.13 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  26.36 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  29.39 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  22.69 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  28.21 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  23.38 
 
 
354 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  30.43 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  26.02 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.71 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  25.83 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.2 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  27.3 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  26.48 
 
 
366 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.45 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  22.41 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  25.32 
 
 
361 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  20.11 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.12 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  22.62 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>