More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1720 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  100 
 
 
389 aa  793    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  77.12 
 
 
389 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  74.29 
 
 
388 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  74.29 
 
 
388 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  63.75 
 
 
390 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  64.78 
 
 
390 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  53.47 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  41.22 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  42.53 
 
 
398 aa  323  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  40.51 
 
 
397 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  40.86 
 
 
400 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  39.43 
 
 
402 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  39.07 
 
 
396 aa  285  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  37.24 
 
 
397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  39.13 
 
 
396 aa  279  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  40 
 
 
385 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  38.87 
 
 
396 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  40.41 
 
 
396 aa  276  5e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  36.01 
 
 
397 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  37.02 
 
 
405 aa  272  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  36.1 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  35.22 
 
 
398 aa  262  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  37.05 
 
 
397 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  37.37 
 
 
394 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  31.63 
 
 
398 aa  200  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  34.29 
 
 
399 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  32.72 
 
 
397 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  33.6 
 
 
407 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  32.91 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  32.16 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  31.32 
 
 
397 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  33.16 
 
 
397 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  33.08 
 
 
419 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  32.43 
 
 
395 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  32.3 
 
 
397 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  32.68 
 
 
397 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  31.04 
 
 
414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  30.53 
 
 
397 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  32.88 
 
 
397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  32.72 
 
 
399 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  30.08 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  30.37 
 
 
397 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.81 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  27.53 
 
 
361 aa  126  8.000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.73 
 
 
347 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.5 
 
 
367 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.79 
 
 
353 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.74 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  29.07 
 
 
347 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  25.32 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  25.32 
 
 
353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  26.73 
 
 
380 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  26.73 
 
 
380 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  26.9 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  27.25 
 
 
380 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.71 
 
 
353 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  29.04 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.46 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  26.77 
 
 
353 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  28.71 
 
 
353 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.71 
 
 
353 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  28.71 
 
 
353 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  28.71 
 
 
353 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.28 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  26.41 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  26.41 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  27.76 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  26.8 
 
 
363 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  24.43 
 
 
369 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  25.47 
 
 
353 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  25.71 
 
 
356 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  26.15 
 
 
356 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  25.96 
 
 
356 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  25.45 
 
 
359 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  25.9 
 
 
356 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  25.38 
 
 
356 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  27.73 
 
 
348 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  26.36 
 
 
364 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  26.1 
 
 
376 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  25.95 
 
 
356 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  25.9 
 
 
356 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  25.71 
 
 
356 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  25.81 
 
 
357 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  26.08 
 
 
376 aa  106  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  27.57 
 
 
369 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  26.11 
 
 
383 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  26.14 
 
 
360 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.11 
 
 
357 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  26.55 
 
 
362 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  26.37 
 
 
360 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  26.1 
 
 
362 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.2 
 
 
356 aa  103  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  23.12 
 
 
351 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  26.58 
 
 
361 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  26.76 
 
 
348 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  25.39 
 
 
362 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  24.38 
 
 
384 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  24.12 
 
 
371 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  26.42 
 
 
364 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>