More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2690 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  80.86 
 
 
397 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  100 
 
 
397 aa  807    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  71.03 
 
 
396 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  65.99 
 
 
396 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  64.48 
 
 
398 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  61.71 
 
 
396 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  61.21 
 
 
396 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  48.85 
 
 
405 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  44.85 
 
 
397 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  43.68 
 
 
397 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  42.03 
 
 
397 aa  330  3e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  42.97 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  39.54 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  40.46 
 
 
398 aa  318  9e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  39.79 
 
 
400 aa  305  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  40.1 
 
 
390 aa  297  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  37.24 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  36.1 
 
 
389 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  38.22 
 
 
385 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  37.21 
 
 
388 aa  275  7e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  36.95 
 
 
388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  37.02 
 
 
387 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  36.79 
 
 
390 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  37.08 
 
 
394 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  34 
 
 
398 aa  230  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  34.09 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  33.16 
 
 
397 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  34.65 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  29.92 
 
 
407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  31.32 
 
 
397 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  31.96 
 
 
395 aa  196  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  31.02 
 
 
397 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  29.95 
 
 
414 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  28.22 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  32.82 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  30.65 
 
 
397 aa  189  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  31.87 
 
 
397 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  29.35 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  32.39 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  31.95 
 
 
398 aa  182  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  29.79 
 
 
419 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  31.51 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  29.74 
 
 
353 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  28.39 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  28.21 
 
 
353 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.72 
 
 
353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  28.21 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  28.21 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  28.21 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  28.32 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  28.46 
 
 
353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  28.21 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  27.25 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.95 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  28.17 
 
 
353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25.32 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  28.32 
 
 
353 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.32 
 
 
365 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.81 
 
 
365 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.81 
 
 
365 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  26.85 
 
 
356 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.81 
 
 
365 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.81 
 
 
365 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.56 
 
 
365 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  26.32 
 
 
364 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.81 
 
 
365 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.81 
 
 
365 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.62 
 
 
364 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.56 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.3 
 
 
365 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.3 
 
 
347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  23.77 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  26.3 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.55 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  25.06 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  25.19 
 
 
362 aa  116  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  26.67 
 
 
353 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.29 
 
 
356 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.29 
 
 
356 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.29 
 
 
356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  25.13 
 
 
362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.29 
 
 
356 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  24.1 
 
 
356 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.78 
 
 
384 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  24.29 
 
 
356 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  26.02 
 
 
362 aa  113  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  27.25 
 
 
347 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  25.52 
 
 
359 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.03 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  24.29 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  24.87 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  26.25 
 
 
383 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  24.38 
 
 
361 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  24.37 
 
 
369 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  29.31 
 
 
359 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  29.31 
 
 
359 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.33 
 
 
378 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  26.87 
 
 
374 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  27.04 
 
 
364 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  24.26 
 
 
373 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>