More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1575 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1575  creatinase  100 
 
 
396 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  75.31 
 
 
397 aa  625  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  71.03 
 
 
397 aa  598  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  66.92 
 
 
398 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  67.68 
 
 
396 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  63.89 
 
 
396 aa  531  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  63.13 
 
 
396 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  48.6 
 
 
405 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  45.43 
 
 
397 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  44.64 
 
 
398 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  43.33 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  42.52 
 
 
400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  40.26 
 
 
402 aa  322  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  41.98 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  40.4 
 
 
397 aa  315  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  39.63 
 
 
385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  40.1 
 
 
390 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  37.37 
 
 
389 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  37.8 
 
 
388 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  37.8 
 
 
388 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  36.1 
 
 
389 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  36.53 
 
 
394 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  37.89 
 
 
390 aa  250  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  37.28 
 
 
387 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  35.59 
 
 
398 aa  238  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  32.66 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  32.08 
 
 
399 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  32.5 
 
 
395 aa  206  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  33.42 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  30.56 
 
 
397 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  30.56 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  30.08 
 
 
397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  33.67 
 
 
399 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  29.32 
 
 
407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  31.75 
 
 
398 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  30.52 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  26.8 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  30.08 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  28.32 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  31.06 
 
 
397 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  29.65 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  29.9 
 
 
397 aa  172  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  29.1 
 
 
369 aa  130  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25.45 
 
 
365 aa  126  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.76 
 
 
353 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.96 
 
 
384 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.91 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  27.84 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  29 
 
 
364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.1 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.58 
 
 
365 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.58 
 
 
365 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.58 
 
 
365 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.58 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.32 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.58 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.58 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.41 
 
 
353 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.63 
 
 
359 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.92 
 
 
353 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.53 
 
 
353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  28.72 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.06 
 
 
365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.37 
 
 
359 aa  113  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  26.49 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.02 
 
 
353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  26.63 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  27.98 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  25.82 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30.55 
 
 
375 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  29.33 
 
 
353 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  27.05 
 
 
386 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  26.99 
 
 
383 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  27.25 
 
 
374 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  27.52 
 
 
369 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  30.03 
 
 
347 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  26.13 
 
 
356 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.62 
 
 
367 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  25.92 
 
 
380 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  25.92 
 
 
380 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  25.12 
 
 
408 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  25.12 
 
 
412 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  24.45 
 
 
376 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  25.44 
 
 
373 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  26.07 
 
 
372 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  23.6 
 
 
362 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  27.61 
 
 
365 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  27.57 
 
 
380 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  28.43 
 
 
356 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  27.43 
 
 
380 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  26.2 
 
 
376 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  26.97 
 
 
359 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  23.77 
 
 
361 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2695  peptidase M24  25.5 
 
 
371 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.103195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>