More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0541 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  100 
 
 		 397 aa  819    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  69.77 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  67.51 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  64.48 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  64.38 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  62.88 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  62.18 
 
 		 397 aa  531  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  60.15 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  60.91 
 
 		 399 aa  524  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  61.32 
 
 		 398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  56.09 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  51.28 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  40.25 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  39.75 
 
 		 414 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  39.55 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  39.09 
 
 		 419 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  36.48 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  34.46 
 
 		 400 aa  229  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  32.64 
 
 		 397 aa  222  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  34.29 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  32.66 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  35.37 
 
 		 405 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  31.76 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  31.52 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  31.35 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  31.77 
 
 		 398 aa  203  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  32.74 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  30.05 
 
 		 397 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  31.43 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  31.02 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  31.11 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  32.03 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  33.8 
 
 		 390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  32.68 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  31.65 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  30.92 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  30.33 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  31.84 
 
 		 389 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  30.67 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  31.56 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  31.01 
 
 		 388 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  30.17 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  28.23 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  28.49 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  24.54 
 
 		 360 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  26.01 
 
 		 358 aa  106  6e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  27.42 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  27.42 
 
 		 351 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  28.61 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  32.18 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.84 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  26.34 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  26.09 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  26.09 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  26.09 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  26.09 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  26.09 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  26.09 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.81 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  25.41 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.42 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  26.09 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.83 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  25.51 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  27.76 
 
 		 356 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.58 
 
 		 365 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  26.48 
 
 		 346 aa  96.3  9e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  27.27 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24.04 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24.04 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.63 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  25.18 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.13 
 
 		 351 aa  94  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  24.06 
 
 		 357 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  25.77 
 
 		 345 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  23.38 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  25.06 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  31.42 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  24.74 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  25.61 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  30.53 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  30.65 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  30.65 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  24.94 
 
 		 348 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.61 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  24.04 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.79 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  25.13 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  23.04 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  26.46 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  26.36 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25.53 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  24.09 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  30.35 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  25.2 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  29.73 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  25.62 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  23.61 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  23.77 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  23.37 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>