More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1962 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1962  Xaa-Pro aminopeptidase  100 
 
 
405 aa  825    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1105  xaa-pro dipeptidase  51.15 
 
 
397 aa  411  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.071673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2690  peptidase M24  48.85 
 
 
397 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000610449  normal  0.0752644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1575  creatinase  48.6 
 
 
396 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0445015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1380  creatinase  46.56 
 
 
396 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0434846  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  49.36 
 
 
398 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2562  peptidase M24  48.6 
 
 
396 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6562099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1651  peptidase M24  48.6 
 
 
396 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  42.46 
 
 
397 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  40.51 
 
 
400 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  41.25 
 
 
398 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  40.4 
 
 
396 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  36.98 
 
 
397 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  36.27 
 
 
397 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  37.02 
 
 
389 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1399  creatinase  35.97 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1813  peptidase M24  41.05 
 
 
385 aa  266  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000026363  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1377  peptidase M24  37.44 
 
 
388 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.209377 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  36.83 
 
 
390 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1345  peptidase M24  37.28 
 
 
389 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2836  peptidase M24  37.11 
 
 
388 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000117604  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  37.86 
 
 
390 aa  252  8.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3617  peptidase M24  38.17 
 
 
387 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.335337  hitchhiker  0.00408279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  36.83 
 
 
394 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0541  peptidase M24  35.37 
 
 
397 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0770334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0649  Xaa-Pro aminopeptidase  36.04 
 
 
397 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0353  peptidase M24  36.06 
 
 
399 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245255  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  35.86 
 
 
395 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2163  peptidase M24  34.96 
 
 
397 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000118517  normal  0.0215342 
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  32.91 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1989  peptidase M24  34.49 
 
 
407 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.758645  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1305  M24 family peptidase  34.5 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.67819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1223  peptidase M24  35.82 
 
 
398 aa  196  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0612  hypothetical protein  35.07 
 
 
397 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2216  peptidase M24  33.68 
 
 
397 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1734  peptidase M24  33.92 
 
 
407 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00987909  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1008  peptidase M24  33.33 
 
 
408 aa  190  5e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.998563  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0162  peptidase M24  34.59 
 
 
399 aa  187  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3039  peptidase M24  33.75 
 
 
419 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0333665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2614  Xaa-Pro aminopeptidase  35.99 
 
 
397 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0888  peptidase M24  33.91 
 
 
397 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0261392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0565  peptidase M24  29.37 
 
 
397 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.245213  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  29.81 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  25.51 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  29.92 
 
 
367 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  25.61 
 
 
353 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.34 
 
 
353 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  27.86 
 
 
347 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.82 
 
 
380 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  23.43 
 
 
369 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.82 
 
 
380 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.09 
 
 
353 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.16 
 
 
365 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.42 
 
 
365 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.42 
 
 
365 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  30.4 
 
 
376 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.57 
 
 
376 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  24.05 
 
 
369 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  26.84 
 
 
353 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  26.84 
 
 
353 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  26.84 
 
 
353 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.42 
 
 
365 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  29.14 
 
 
353 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  28.73 
 
 
358 aa  100  7e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  29.14 
 
 
353 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  29.14 
 
 
353 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.63 
 
 
348 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.58 
 
 
353 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2129  Xaa-Pro dipeptidase  29.4 
 
 
363 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  27.95 
 
 
356 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.42 
 
 
365 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.42 
 
 
365 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  28.81 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.91 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.42 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.16 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  30.1 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.35 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  29.74 
 
 
357 aa  97.4  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.65 
 
 
365 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  25.9 
 
 
353 aa  97.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  27.09 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  28.48 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.33 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  27.89 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  29.61 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  25.45 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  27.89 
 
 
359 aa  95.5  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  22.82 
 
 
356 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.14 
 
 
365 aa  94.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30.86 
 
 
375 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.29 
 
 
357 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  27.37 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  24.56 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  26.25 
 
 
393 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  22.65 
 
 
352 aa  92  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  25.45 
 
 
362 aa  92  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  25.52 
 
 
364 aa  91.3  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  27.91 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  29.26 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.75509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>