More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4913 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  100 
 
 
393 aa  816    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  74.42 
 
 
393 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  57.07 
 
 
388 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  56.81 
 
 
388 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  55.5 
 
 
388 aa  449  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1829  peptidase M24  44.3 
 
 
385 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2710  peptidase M24  39.42 
 
 
387 aa  272  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529635  normal  0.905643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  27.56 
 
 
372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  26.76 
 
 
357 aa  129  6e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  34.85 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  32.76 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  27.75 
 
 
380 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  27.75 
 
 
380 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  25.62 
 
 
396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  26.27 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  29.44 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  25.33 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.61 
 
 
353 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  25.9 
 
 
369 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  32.64 
 
 
358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  28.49 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.69 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  25.2 
 
 
351 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  25.2 
 
 
351 aa  113  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  26.63 
 
 
353 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  26.63 
 
 
353 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  24.2 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  26.42 
 
 
405 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.48 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  30.22 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  28.86 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  30.08 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  29.26 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  27.27 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.23 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  28.27 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  31.66 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  27.75 
 
 
378 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  31.9 
 
 
356 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.3 
 
 
367 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  28.1 
 
 
361 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  27.91 
 
 
359 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  27.49 
 
 
408 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  28.65 
 
 
373 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  29.34 
 
 
323 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  27.42 
 
 
404 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  27.22 
 
 
375 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  26.27 
 
 
353 aa  106  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7500  peptidase M24  24.87 
 
 
398 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137985  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  27.78 
 
 
352 aa  106  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  26.01 
 
 
386 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  26.17 
 
 
394 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  25.99 
 
 
366 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  25.57 
 
 
398 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  28.84 
 
 
374 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  27.15 
 
 
346 aa  105  1e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  25.2 
 
 
361 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  31.35 
 
 
364 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  24.24 
 
 
354 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.88 
 
 
353 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  32.08 
 
 
356 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.79 
 
 
364 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  25.27 
 
 
353 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  27.24 
 
 
361 aa  103  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  27.98 
 
 
401 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  28.07 
 
 
366 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  26.81 
 
 
380 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  26.32 
 
 
383 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.81 
 
 
356 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.12 
 
 
365 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  28.3 
 
 
388 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.07 
 
 
353 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  24.14 
 
 
356 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.35 
 
 
364 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  24.8 
 
 
435 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  29.93 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  31.78 
 
 
363 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  25.4 
 
 
359 aa  99.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  24.2 
 
 
353 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.53 
 
 
356 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  24.47 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1720  peptidase M24  23.77 
 
 
389 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000408429  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  24.2 
 
 
353 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  29.79 
 
 
355 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  24.2 
 
 
353 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  25.8 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  24.54 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  23.87 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  24.8 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.54 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  24.2 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.47 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  27.04 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  32 
 
 
348 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  27.06 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2518  peptidase M24  23.85 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  26.05 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  27.46 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  27.06 
 
 
400 aa  98.6  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>