More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04935 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  100 
 
 		 393 aa  815    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  74.42 
 
 		 393 aa  622  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  57.7 
 
 		 388 aa  471  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  57.18 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  56.92 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1829  peptidase M24  41.87 
 
 		 385 aa  305  8.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2710  peptidase M24  38.89 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529635  normal  0.905643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  28.61 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  26.8 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  25.5 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  25.41 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  32.74 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  27.45 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  27.45 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.12 
 
 		 380 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.12 
 
 		 380 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  32.68 
 
 		 357 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  28.61 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.9 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  32.37 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  26.12 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  29.53 
 
 		 359 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  29.23 
 
 		 448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  29.53 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  27.91 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.25 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  27.64 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  26.89 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  25.88 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.67 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.14 
 
 		 356 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  28.95 
 
 		 358 aa  110  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  26.42 
 
 		 369 aa  110  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  23.51 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.53 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  30.12 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  30.77 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  26.27 
 
 		 364 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  25.94 
 
 		 397 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  28.51 
 
 		 323 aa  106  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  28.46 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  27.08 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  27.13 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  25.93 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  25.93 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  23.87 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.14 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7500  peptidase M24  26.28 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  26.56 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4362  peptidase M24  25.64 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000064501  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  28.92 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  24.75 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  30.53 
 
 		 356 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  26.81 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  25.5 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  27.32 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.14 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.14 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  25.99 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  29.77 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  27.11 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  32.21 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  27.97 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.14 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  27.2 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  25.82 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  27.85 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.34 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.61 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.34 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  25.21 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25.42 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  27.92 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  23.72 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.86 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  25.96 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1338  peptidase M24  26.74 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0496679  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1610  peptidase M24  25.6 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.75509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  29.01 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  29.01 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  29.35 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.86 
 
 		 365 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  27.72 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  27.84 
 
 		 361 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  29.39 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  30.17 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  32.74 
 
 		 348 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  27.4 
 
 		 345 aa  100  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.59 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  25.73 
 
 		 356 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.86 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  29.39 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1673  peptidase M24  30.04 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0480617  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  27.89 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  25.34 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1135  peptidase M24  25 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0425552  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.62 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  30.2 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  25.14 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  27.78 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>