More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4362 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4362  peptidase M24  100 
 
 
401 aa  820    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000064501  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  31.96 
 
 
381 aa  145  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  32.65 
 
 
380 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  31.17 
 
 
372 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  29.87 
 
 
373 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  28.98 
 
 
367 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  38.71 
 
 
348 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  25.33 
 
 
369 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  30.18 
 
 
374 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  27.34 
 
 
371 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.82 
 
 
357 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  31.95 
 
 
357 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  31.68 
 
 
336 aa  104  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  33.59 
 
 
348 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.86 
 
 
351 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.86 
 
 
351 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  28.35 
 
 
378 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  27 
 
 
400 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.99 
 
 
353 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  31.12 
 
 
357 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  28.28 
 
 
356 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  23.3 
 
 
351 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  25.65 
 
 
353 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  28.86 
 
 
376 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  29.46 
 
 
376 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  32.63 
 
 
346 aa  101  3e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  27.32 
 
 
356 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.38 
 
 
356 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.38 
 
 
376 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  29.56 
 
 
323 aa  99.8  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  27.84 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  28.32 
 
 
375 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.2 
 
 
353 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  26.99 
 
 
371 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  29.02 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  29.77 
 
 
323 aa  99  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.2 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.46 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  25.64 
 
 
393 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.2 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.2 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.2 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5221  peptidase M24  26.29 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0493445  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1506  Xaa-Pro peptidase  28.74 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.2 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.68 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  29.72 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  29.72 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  27.56 
 
 
353 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  30.67 
 
 
374 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  27.16 
 
 
358 aa  96.7  6e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  22.73 
 
 
356 aa  96.3  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  28.27 
 
 
365 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  26.12 
 
 
367 aa  96.7  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1210  Xaa-Pro peptidase  32.37 
 
 
345 aa  95.9  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.628716  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  22.99 
 
 
356 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  28.27 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  24.93 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  28.27 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  28.27 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.47 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  31.64 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  25 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  28.27 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  28.27 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0369  DNA polymerase III gamma and tau subunits  32.45 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000259471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  24.93 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  28.27 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  30.42 
 
 
353 aa  95.5  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  22.46 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.15 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  27.23 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  23.87 
 
 
357 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  22.87 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  28.57 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2124  peptidase M24  30.56 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  24.06 
 
 
353 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  27.92 
 
 
365 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  29.66 
 
 
384 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  22.46 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  22.83 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  22.57 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  22.83 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  24.87 
 
 
358 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  22.87 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  24.1 
 
 
393 aa  93.2  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.66 
 
 
365 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  24.09 
 
 
369 aa  93.2  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  42.61 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  27.92 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  35.86 
 
 
373 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  25.7 
 
 
361 aa  92.8  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  24.27 
 
 
359 aa  92.8  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2391  peptidase M24  40 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.73833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  25.72 
 
 
359 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  41.18 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  31.84 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  27.65 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  22.87 
 
 
356 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>