More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2710 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2710  peptidase M24  100 
 
 		 387 aa  774    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529635  normal  0.905643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1829  peptidase M24  53.46 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  44.83 
 
 		 388 aa  339  5e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  44.03 
 
 		 388 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  44.56 
 
 		 388 aa  319  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  39.42 
 
 		 393 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  38.89 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  26.53 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  27.92 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  27.92 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.57 
 
 		 380 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.57 
 
 		 380 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.48 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  27.93 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.17 
 
 		 380 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  31.74 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  27.46 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  23.06 
 
 		 361 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  26.85 
 
 		 359 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  23.28 
 
 		 357 aa  99.4  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  28.13 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.8 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.8 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7500  peptidase M24  25.51 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  25.13 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  22.83 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  25.79 
 
 		 352 aa  96.7  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1099  peptidase M24  25.47 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000369045  normal  0.41129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.58 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  29.1 
 
 		 353 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  23.31 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  24.93 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  23.31 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.13 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  26.15 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.59 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.32 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  27.09 
 
 		 383 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.77 
 
 		 365 aa  93.2  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  29.21 
 
 		 419 aa  92.8  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  25.39 
 
 		 353 aa  93.2  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.87 
 
 		 365 aa  93.2  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  23.73 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  21.47 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  27.13 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  29.72 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  24.14 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  28.41 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  32.91 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  24.46 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  26.91 
 
 		 323 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2684  peptidase M24  27.22 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.045343  normal  0.0582018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  25.72 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01441  proline dipeptidase  25.7 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  24.73 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.05 
 
 		 356 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  28.33 
 
 		 358 aa  90.9  4e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1058  peptidase M24  27.29 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.06 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  31.8 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.2 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.05 
 
 		 356 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.05 
 
 		 356 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  28.14 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  26.16 
 
 		 353 aa  90.1  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  23.8 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  24.32 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  24.05 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  27.1 
 
 		 372 aa  89.4  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  26.2 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  25 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  30.93 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.27 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  28.24 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  25.27 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  21.43 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  31.15 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  24.33 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  25.52 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  25.13 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  28.02 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  24.67 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  24 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  28.02 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  27.25 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  21.43 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  24.41 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  24.41 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.8 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  24.41 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  28.63 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  24.41 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  24.53 
 
 		 363 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  26.63 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  24.87 
 
 		 353 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>