More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1058 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1058  peptidase M24  100 
 
 		 432 aa  870    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  24.39 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2710  peptidase M24  27.15 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529635  normal  0.905643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0666  peptidase M24  23.53 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  23.08 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  23.08 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  29.48 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  19.71 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  21.56 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  21.67 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  23.51 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  20.67 
 
 		 356 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  26.3 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  20.67 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  20.67 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  20.67 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  25.09 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  18.62 
 
 		 356 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  21.36 
 
 		 356 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  25.73 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  20.33 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  28.02 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  28.02 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  22.97 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2365  peptidase M24  22.39 
 
 		 400 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  20.38 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  27.63 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  22.02 
 
 		 353 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  25.42 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3747  putative dipeptidase  26.64 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.93962  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3478  peptidase M24  26.64 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  23.6 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  28.29 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2381  peptidase M24  21.88 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.29 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  21.23 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0663  peptidase M24  25.09 
 
 		 387 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  21.9 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  25 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  22.11 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  21.23 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  27.27 
 
 		 265 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  21.77 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  21.91 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0451  peptidase M24  22.18 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.402319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  20.81 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.59 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.59 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  21.68 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  21.53 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  21.53 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  21.53 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  21.53 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  24.19 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  21.77 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  22.03 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  21.77 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  23.29 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  23.29 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  21.55 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  21.55 
 
 		 353 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  21.77 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  27.42 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  20.05 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  18.81 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  21.55 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2242  putative endopeptidase  22.22 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  21.55 
 
 		 353 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2132  putative endopeptidase  22.22 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  22.89 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  27.49 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  24.73 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  20.28 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  23.09 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2140  putative endopeptidase  22.66 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332227  normal  0.318783 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  22.44 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  22.43 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  22.25 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  21.25 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  25.99 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  25.1 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  25.1 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  26.94 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  28.5 
 
 		 371 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  21.77 
 
 		 365 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  19.86 
 
 		 388 aa  57  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  20 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  21.24 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  21.7 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0463  peptidase M24  22.39 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00525602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  23.05 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  25.1 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5108  peptidase M24  22.12 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239431  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0969  methionine aminopeptidase, type I  25.14 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  25 
 
 		 263 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  29.53 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  24.53 
 
 		 374 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  21.97 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  24.21 
 
 		 323 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  24.6 
 
 		 377 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>