More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5108 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5108  peptidase M24  100 
 
 		 434 aa  899    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239431  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  87.5 
 
 		 415 aa  731    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2381  peptidase M24  63.51 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0354  peptidase M24  45.55 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  42.93 
 
 		 422 aa  344  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4752  aminopeptidase, putative  44.16 
 
 		 435 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00197611  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2884  peptidase M24  43 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  39.84 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  38.01 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1559  peptidase M24  40.11 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1779  peptidase M24  34.81 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0971703  normal  0.379235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1016  peptidase M24  33.92 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  28.37 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  27.75 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  28.18 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  27.15 
 
 		 449 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  26.44 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  29.78 
 
 		 424 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  29.05 
 
 		 348 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  26.63 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  27.64 
 
 		 353 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  31.21 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  26.65 
 
 		 356 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  33.33 
 
 		 348 aa  93.2  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  29.48 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  26.29 
 
 		 353 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.08 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  26.03 
 
 		 353 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  25.26 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  26.29 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  26.29 
 
 		 353 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.55 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  26.29 
 
 		 353 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  26.29 
 
 		 353 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.32 
 
 		 353 aa  87.8  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  23.7 
 
 		 353 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  23.7 
 
 		 353 aa  87  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.03 
 
 		 353 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  25.77 
 
 		 353 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  25.93 
 
 		 377 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  28.12 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  27.18 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  28.18 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.09 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  25.62 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  25.52 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  25.62 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  25 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  25.13 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  22.31 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.84 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  26.11 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  29.57 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  29.57 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  28.51 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  29.57 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  29.57 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2421  peptidase M24  25.57 
 
 		 377 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1485  peptidase M24  26.97 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  29.79 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  25.67 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  24.17 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  27.72 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  26.49 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  28.79 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  32.33 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  29.18 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  28.79 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0152  aminopeptidase P  24.9 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  26.79 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  28.79 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  30.35 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  25.59 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  25 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  24.63 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  23.22 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  29.18 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  28.79 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  29.18 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  29.18 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  29.18 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  25.54 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  29.18 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  28.05 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  27.31 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2407  peptidase M24  27.07 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.145734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  26.88 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  23.87 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  24.16 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.19 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  29.93 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  28.69 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  27.52 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  27.52 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.62 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  24.29 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  25.92 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  27.52 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  25.73 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  24.93 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>