More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2110 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  100 
 
 
428 aa  878    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  85.07 
 
 
415 aa  749    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  66.67 
 
 
433 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  63.73 
 
 
429 aa  541  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  55.72 
 
 
449 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  35.97 
 
 
424 aa  202  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  35.08 
 
 
429 aa  199  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1559  peptidase M24  29.21 
 
 
436 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  27.36 
 
 
422 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2381  peptidase M24  27.88 
 
 
427 aa  129  9.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5108  peptidase M24  28.1 
 
 
434 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239431  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  29.63 
 
 
415 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4752  aminopeptidase, putative  29.62 
 
 
435 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00197611  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  28.82 
 
 
426 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0354  peptidase M24  28.04 
 
 
419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  26.53 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  26.53 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  27.78 
 
 
426 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  28.87 
 
 
369 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  31.91 
 
 
353 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  30.71 
 
 
357 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  30.28 
 
 
348 aa  99.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  29.8 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  29.8 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  30.64 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  29.56 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  31.25 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  31.25 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  30.83 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  29.83 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  30.83 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.61 
 
 
376 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  30.83 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  29.23 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  30.83 
 
 
353 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  30.83 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  30.83 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  26.02 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  30.83 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  31.25 
 
 
353 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.23 
 
 
353 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  30.71 
 
 
354 aa  93.2  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  29.84 
 
 
364 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  30.92 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  29.96 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  23.63 
 
 
353 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  30 
 
 
357 aa  90.1  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  30.47 
 
 
366 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  29.66 
 
 
376 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  29.91 
 
 
360 aa  89  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  30.13 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  28.63 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  29.41 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  28.92 
 
 
364 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2421  peptidase M24  28.82 
 
 
377 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.549884  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  27.02 
 
 
359 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  33.33 
 
 
356 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  28.76 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  30.71 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  31.65 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  30.86 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  29.34 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  23.18 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  26.21 
 
 
356 aa  84  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  30.04 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.7 
 
 
357 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  29.17 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2884  peptidase M24  24.37 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  28.09 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  25.79 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  29.13 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  30.93 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  28.1 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  28.4 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  32.44 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  30.12 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  25.38 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  28.4 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2376  peptidase M24  31.43 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  27 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  31.32 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  31.02 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.76 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  29.44 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  22.92 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  28.63 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  26.55 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  28.63 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  31.62 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29.03 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  28.63 
 
 
365 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  28.63 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  26.64 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  28.63 
 
 
365 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  29.32 
 
 
365 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  23.04 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  28.63 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  31.62 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1016  peptidase M24  24.75 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>