More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4474 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  100 
 
 
415 aa  855    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  87.01 
 
 
428 aa  748    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  67.15 
 
 
433 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  63.02 
 
 
429 aa  548  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  56.47 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  36.14 
 
 
424 aa  199  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  34.61 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1559  peptidase M24  29.76 
 
 
436 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  26.68 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  26.68 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4752  aminopeptidase, putative  28.03 
 
 
435 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00197611  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  28.3 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  25.37 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5108  peptidase M24  26.44 
 
 
434 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239431  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0354  peptidase M24  25.44 
 
 
419 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2381  peptidase M24  26.13 
 
 
427 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  27.34 
 
 
426 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  26.64 
 
 
353 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  29.25 
 
 
357 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  29.6 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  29.49 
 
 
348 aa  97.8  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  28.85 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  29.39 
 
 
353 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.91 
 
 
353 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  29.39 
 
 
353 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  24.64 
 
 
426 aa  96.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  28.98 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  31.05 
 
 
364 aa  96.7  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  28.98 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  28.98 
 
 
353 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  28.98 
 
 
353 aa  96.3  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  28.98 
 
 
353 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  28.98 
 
 
353 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  28.98 
 
 
353 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  26.78 
 
 
354 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  29.21 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  30.21 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  29.8 
 
 
353 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  31.62 
 
 
356 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  30.5 
 
 
361 aa  94  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  30.43 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.64 
 
 
376 aa  93.6  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  29.53 
 
 
364 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  30.34 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  32.08 
 
 
354 aa  90.9  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  27.82 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  31.89 
 
 
376 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  32.94 
 
 
386 aa  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  27.14 
 
 
377 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  27.14 
 
 
377 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  31.1 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  31.51 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  27.41 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  26.8 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  29.05 
 
 
351 aa  87  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  30.59 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  24.6 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1779  peptidase M24  25.32 
 
 
443 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0971703  normal  0.379235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  28.93 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  31.98 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6520  peptidase M24  26.57 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.180886 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  28.14 
 
 
358 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  27.52 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  26.57 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  30.17 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  29.88 
 
 
356 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  28.15 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  30.36 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  30.36 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.93 
 
 
357 aa  84  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  26.77 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  28.87 
 
 
336 aa  84  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  33.19 
 
 
384 aa  84  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  30.12 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  29.92 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  29.96 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  28.74 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  29.48 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  29.48 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  28.79 
 
 
362 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  27.59 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  29.08 
 
 
356 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  26.96 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  31.4 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  31.76 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  25.75 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3777  peptidase M24  28.03 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  29.75 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2295  Fis family transcriptional regulator  32.64 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0157363 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  29.88 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  31.22 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  26.62 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  30.31 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  30.65 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  28.28 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  30.27 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  26.29 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.67 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  31.62 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  30.95 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.445473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>