More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0928 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  100 
 
 		 433 aa  900    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  63.55 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  67.15 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  66.67 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  58.92 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  35.93 
 
 		 429 aa  213  7e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  35.65 
 
 		 424 aa  209  6e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5108  peptidase M24  28.37 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.239431  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1559  peptidase M24  28.12 
 
 		 436 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2916  peptidase M24  28.75 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  26.88 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2381  peptidase M24  27.71 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  27.65 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  25.68 
 
 		 426 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0354  peptidase M24  24.31 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  27.09 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  27.09 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4752  aminopeptidase, putative  26.15 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00197611  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  26.43 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  28.97 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  30.1 
 
 		 348 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  27.58 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  33.74 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  27.02 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.43 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  32.08 
 
 		 354 aa  97.8  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3777  peptidase M24  26.18 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.312064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2884  peptidase M24  24.2 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3765  peptidase M24  26.18 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3838  peptidase M24  26.18 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  32.1 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  30.59 
 
 		 357 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  30.38 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  29.19 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  29.19 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  30.77 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  27.04 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  31.47 
 
 		 347 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.09 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  27.11 
 
 		 448 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  25.73 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  28.69 
 
 		 357 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  27.88 
 
 		 374 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  29.13 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.91 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  29.62 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  31.67 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30.8 
 
 		 375 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4232  peptidase M24  24.42 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  32.62 
 
 		 380 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  25.81 
 
 		 393 aa  86.3  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.88 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  27.55 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  32.08 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  32.08 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  32.08 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2473  peptidase M24  30.95 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  31.75 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  31.25 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2420  peptidase M24  24.76 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  31.25 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  28.29 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  32.51 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  31.38 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  29.66 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  31.25 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  26.55 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  24.16 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1016  peptidase M24  23.81 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  25.51 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  25.78 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.69 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  29.05 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  25.51 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.69 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1779  peptidase M24  23.74 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0971703  normal  0.379235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  24.25 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  29.79 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  28.74 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  27.46 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  25.32 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  23.16 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  26.61 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  31.13 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  26.92 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  28.22 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  27.09 
 
 		 361 aa  79.7  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  25.51 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  23.73 
 
 		 393 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  29.34 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.8 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.8 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.8 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.8 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  28.01 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.8 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.8 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  31.67 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.8 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  31.09 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>