More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0287 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  81.93 
 
 		 393 aa  680    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  87.02 
 
 		 393 aa  724    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  82.19 
 
 		 393 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  83.46 
 
 		 393 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  100 
 
 		 393 aa  817    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  77.95 
 
 		 392 aa  645    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  71.36 
 
 		 403 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  68.8 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  69.07 
 
 		 406 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  71.21 
 
 		 402 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  68.8 
 
 		 399 aa  574  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  70.95 
 
 		 402 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  70.95 
 
 		 402 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  70.95 
 
 		 402 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  70.69 
 
 		 402 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  70.69 
 
 		 402 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  67.92 
 
 		 371 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  65.08 
 
 		 419 aa  528  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  61.68 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  60.97 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  50.77 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  49.22 
 
 		 392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  47.93 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  47.15 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  47.44 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  43.99 
 
 		 393 aa  348  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  44.5 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  34.18 
 
 		 432 aa  206  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  32.23 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  31.42 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  32.41 
 
 		 418 aa  189  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  30.56 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  30.77 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  31.3 
 
 		 394 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  31.71 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  32.44 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  29.62 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  31.46 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  29 
 
 		 387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  30.31 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  30.31 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  29.75 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  30.15 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  28.57 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  26.09 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  28.86 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  29.04 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  29.67 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  28.97 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  29.55 
 
 		 383 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 		 461 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  27.85 
 
 		 384 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  28.17 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  27.39 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.18 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  25.85 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.13 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  27.2 
 
 		 373 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.52 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  26.42 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  26.52 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  24.61 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  24.87 
 
 		 369 aa  106  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  26.63 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  29.11 
 
 		 348 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.65 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  24.21 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  23.51 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  23.63 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  24.34 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  24.81 
 
 		 381 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  27.06 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  22.86 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.12 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.12 
 
 		 365 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  23.12 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  22.86 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  23.12 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  23.12 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  22.86 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.39 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  22.86 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  23.04 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  25.33 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  23.95 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  24.21 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  22.86 
 
 		 365 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  25.19 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  25.19 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  22.51 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  25.06 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  24.12 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.12 
 
 		 365 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  24.46 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  25.77 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  24.94 
 
 		 374 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  25.69 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  24.37 
 
 		 357 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  24.42 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  23.86 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>