More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2053 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  100 
 
 
394 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  88.69 
 
 
394 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  89.2 
 
 
394 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  77.92 
 
 
397 aa  579  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  73.65 
 
 
388 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  37.4 
 
 
434 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  35.75 
 
 
432 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  38.28 
 
 
387 aa  242  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  35.96 
 
 
425 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  36.51 
 
 
414 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  38.28 
 
 
403 aa  236  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  38.21 
 
 
418 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  31.9 
 
 
393 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  31.04 
 
 
393 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  32.65 
 
 
393 aa  189  9e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  34.38 
 
 
384 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  32.06 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  29.7 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  29.85 
 
 
393 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  32.32 
 
 
392 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  30.36 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  29.59 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  30.36 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  30 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  28.9 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  33.43 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  30 
 
 
392 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  29.85 
 
 
402 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  28.07 
 
 
395 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  27.41 
 
 
419 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  29.85 
 
 
402 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  29.85 
 
 
402 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  36.41 
 
 
398 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  33.77 
 
 
390 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  28.83 
 
 
406 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  30.45 
 
 
383 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  29.92 
 
 
383 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  28.32 
 
 
403 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  27.95 
 
 
399 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  30.18 
 
 
383 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  29.25 
 
 
397 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  27.88 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  27.18 
 
 
396 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  28.21 
 
 
389 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  29.04 
 
 
393 aa  149  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  27.17 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  32.25 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  31.83 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  30.2 
 
 
392 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  32.25 
 
 
383 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  30.21 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  31.47 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 
461 aa  132  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.18 
 
 
351 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.18 
 
 
351 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  30.14 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  30.29 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25.54 
 
 
365 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.23 
 
 
359 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  25.96 
 
 
359 aa  126  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  23.2 
 
 
351 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  31.38 
 
 
371 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.54 
 
 
365 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.86 
 
 
365 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.59 
 
 
365 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.86 
 
 
365 aa  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.86 
 
 
365 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.86 
 
 
365 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.86 
 
 
365 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.86 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  27.71 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  31.38 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.59 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  34.57 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  25.07 
 
 
364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  23.43 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.59 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  29.02 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  23.43 
 
 
358 aa  120  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  31.1 
 
 
372 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  27.37 
 
 
357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  27.68 
 
 
380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  31.02 
 
 
367 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  29.22 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  29.38 
 
 
380 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  29.38 
 
 
380 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  29.62 
 
 
356 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  29.81 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  30.34 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  27.97 
 
 
375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.98 
 
 
376 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  30.53 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.39 
 
 
356 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.04 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  24.93 
 
 
369 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  26.93 
 
 
367 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  23.43 
 
 
353 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  23.23 
 
 
353 aa  109  1e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  28.53 
 
 
369 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  22.83 
 
 
356 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>