More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1921 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  100 
 
 		 389 aa  807    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  52.96 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  52.19 
 
 		 393 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  52.21 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  50.52 
 
 		 392 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  50 
 
 		 406 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  50.9 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  50.77 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  48.45 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  48.19 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  47.67 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  49.1 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  51.3 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  49.23 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  49.1 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  48.72 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  48.97 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  49.35 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  48.97 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  48.08 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  47.03 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  44.1 
 
 		 392 aa  330  3e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  42.71 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  42.16 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  39.38 
 
 		 392 aa  292  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  36.39 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  36.25 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  30.96 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  29.92 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  29.52 
 
 		 425 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  31.81 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  28.72 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  28.93 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  30.28 
 
 		 387 aa  166  6.9999999999999995e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  31 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  28.28 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  27.25 
 
 		 394 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  27.76 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  27.25 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  26.11 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  26.75 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  25.75 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  28.39 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  25.33 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  28.13 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  26.3 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  26.26 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  24.55 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  25.06 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  25.06 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  25.38 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  25.58 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  25.53 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  25.56 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  23.92 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.96 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1159  peptidase M20  45.45 
 
 		 171 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0202669 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  25.32 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  25.19 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  23.85 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  24.69 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  23.51 
 
 		 359 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  27.01 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  25.07 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  25.77 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  22.68 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  23.23 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  24.49 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  22.22 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  24.13 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  24.13 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  21.35 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  25.7 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  24.56 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  24.56 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  26.13 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  21.96 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  25.39 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  23.54 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  24.1 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  21.76 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  22.72 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  23.96 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.2 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  23.2 
 
 		 353 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.96 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.96 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  23.36 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  23.96 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  23.69 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  25.13 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.96 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  23.36 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  24.94 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  23.9 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  26.83 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  23.2 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.64 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  23.96 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  26.83 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>