More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3436 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  100 
 
 		 397 aa  781    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  77.92 
 
 		 394 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  76.88 
 
 		 394 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  77.14 
 
 		 394 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  71.39 
 
 		 388 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  36.2 
 
 		 432 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  35.49 
 
 		 414 aa  242  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  36.75 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  35.58 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  35.06 
 
 		 425 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  38.58 
 
 		 403 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  38.66 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  33.16 
 
 		 392 aa  196  6e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  31.97 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  31.79 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  30.77 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  29.56 
 
 		 392 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  30.59 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  31.79 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  30.08 
 
 		 393 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  30.08 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  35.08 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  29.23 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  31.03 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  29.23 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  29.23 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  29.49 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  29.23 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  29.23 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  28.46 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  29.49 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  29.49 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  33.72 
 
 		 383 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  31.23 
 
 		 384 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  35.48 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  28.83 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  27.41 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  28.24 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  30.25 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  31.46 
 
 		 392 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  28.28 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  33.43 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  33.04 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  30.2 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  29.12 
 
 		 383 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  26.72 
 
 		 371 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  29.12 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  32.54 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  31.55 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  28.82 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  29.59 
 
 		 370 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  27.87 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  27.32 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  23.9 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  28.05 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  23.9 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  23.9 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  29.97 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25.41 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  29.75 
 
 		 380 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0268  peptidase M24  33.44 
 
 		 388 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  31.34 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  29.41 
 
 		 373 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  29.77 
 
 		 437 aa  123  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  22.76 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  23.1 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  23.1 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  22.93 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.91 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.18 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.18 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.18 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  29.89 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.18 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.18 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.18 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.18 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  29.66 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  22.49 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.46 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  32.1 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  21.29 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.91 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  21.86 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.32 
 
 		 364 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.49 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  23.6 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  21.95 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  22.22 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  29.37 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  30.15 
 
 		 374 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  22.28 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  24.05 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  29.3 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  26.21 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  27.25 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  28.07 
 
 		 376 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  23.51 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  23.66 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  28.99 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>