More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4432 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  100 
 
 		 371 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  79.73 
 
 		 406 aa  634    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  83.02 
 
 		 396 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  79.78 
 
 		 403 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  78.71 
 
 		 399 aa  631  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  79.25 
 
 		 402 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  79.25 
 
 		 402 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  78.71 
 
 		 402 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  78.44 
 
 		 402 aa  607  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  78.98 
 
 		 402 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  78.98 
 
 		 402 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  70.89 
 
 		 393 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  70.89 
 
 		 393 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  69.81 
 
 		 393 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  69.27 
 
 		 393 aa  551  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  67.65 
 
 		 392 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  67.92 
 
 		 393 aa  539  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  66.13 
 
 		 419 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  61.46 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  59.46 
 
 		 392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  47.03 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  46.79 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  45.82 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  44.47 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  44.47 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  43.05 
 
 		 397 aa  325  8.000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  42.97 
 
 		 393 aa  319  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  29.66 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  29.84 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  29.58 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  27.93 
 
 		 414 aa  159  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  29.44 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  27.17 
 
 		 394 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  28.5 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  27.45 
 
 		 388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  27.27 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  26.46 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  27.38 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  26.98 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  26.98 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  27.13 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  27.88 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  23.81 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  25 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  25 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  24.47 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  28.19 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  24.93 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  27.07 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.73 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  27.84 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  26.06 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  25.74 
 
 		 461 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  24.93 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  26.32 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  24 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  27.36 
 
 		 383 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25.79 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.26 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.26 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  27.45 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  22.19 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  25.65 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.93 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.93 
 
 		 365 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.93 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.93 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  21.96 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.93 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  21.96 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  24.86 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.93 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  22.75 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1159  peptidase M20  42.71 
 
 		 171 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0202669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.93 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  21.69 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  21.69 
 
 		 356 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  26.73 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  26.27 
 
 		 323 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  28.19 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  22.34 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  24.71 
 
 		 369 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  25.33 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  24.54 
 
 		 374 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  22.73 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  26.34 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  26.14 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  22.99 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  22.55 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  26.82 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  25.17 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  26.05 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  26.29 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  22.85 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  21.76 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  22.87 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  26.03 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.72 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  24.42 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>