More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0063 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  79.73 
 
 
371 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  85.19 
 
 
403 aa  732    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  84.21 
 
 
402 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  100 
 
 
406 aa  846    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  84.46 
 
 
402 aa  692    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  84.71 
 
 
402 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  83.96 
 
 
402 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  84.46 
 
 
402 aa  692    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  79.9 
 
 
396 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  83.96 
 
 
402 aa  691    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  86.15 
 
 
399 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  71.13 
 
 
393 aa  584  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  70.69 
 
 
393 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  70.26 
 
 
393 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  70.1 
 
 
393 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  68.29 
 
 
392 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  69.07 
 
 
393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  66.58 
 
 
419 aa  541  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  59.9 
 
 
395 aa  484  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  59.23 
 
 
392 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  50 
 
 
389 aa  408  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  47.67 
 
 
392 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  46.89 
 
 
393 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  46.63 
 
 
392 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  46.29 
 
 
392 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  44.76 
 
 
397 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  44.27 
 
 
393 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  30.75 
 
 
432 aa  176  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  31 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  30.75 
 
 
418 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  29.62 
 
 
434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  29.23 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  28.93 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  28.83 
 
 
394 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  28.64 
 
 
387 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  29.92 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  25.52 
 
 
437 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  27.11 
 
 
403 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  28.8 
 
 
388 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  28.25 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  29.1 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  29.1 
 
 
383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  27.69 
 
 
394 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  27.69 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  27.79 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  29.26 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  28.69 
 
 
383 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  27.82 
 
 
383 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  27.3 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  25.77 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  26.07 
 
 
384 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  27.2 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  25.38 
 
 
461 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  25.85 
 
 
357 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  25.2 
 
 
370 aa  106  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  26.67 
 
 
369 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  24.04 
 
 
390 aa  100  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  23.2 
 
 
356 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  25.13 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  25.84 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  25.26 
 
 
369 aa  93.6  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  22.66 
 
 
356 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.58 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  24.16 
 
 
358 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  23.58 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  26.88 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  24.68 
 
 
362 aa  90.5  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  27.08 
 
 
448 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  26.47 
 
 
364 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.45 
 
 
367 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  23.64 
 
 
358 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  22.94 
 
 
356 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  22.31 
 
 
356 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  23.32 
 
 
361 aa  87  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  22.56 
 
 
356 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  22.56 
 
 
356 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  25.89 
 
 
355 aa  86.7  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  25 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  22.4 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  25.19 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  27.42 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1159  peptidase M20  40.43 
 
 
171 aa  85.5  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0202669 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  22.67 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  25.44 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  21.24 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  24.44 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.09 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  24.44 
 
 
380 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  22.28 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  24.81 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  21.91 
 
 
356 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  27.39 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  22.05 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  24.53 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  24.87 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  21.3 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  23.36 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  25.44 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  22.6 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>