More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1643 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  74.25 
 
 
425 aa  686    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  100 
 
 
434 aa  905    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  72.46 
 
 
414 aa  631  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  68.3 
 
 
432 aa  624  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  73.2 
 
 
418 aa  586  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  64.85 
 
 
403 aa  552  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  64.16 
 
 
387 aa  532  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  37.4 
 
 
394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  38.18 
 
 
394 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  35.58 
 
 
397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  37.66 
 
 
394 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  37.64 
 
 
388 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  34.1 
 
 
393 aa  207  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  32.47 
 
 
392 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  33.84 
 
 
392 aa  202  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  29.2 
 
 
437 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  31.42 
 
 
393 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  30.94 
 
 
392 aa  190  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  30.85 
 
 
393 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  32.07 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  31.54 
 
 
392 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  30.1 
 
 
393 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  30.23 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  30.45 
 
 
393 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  29.57 
 
 
396 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  28.72 
 
 
389 aa  171  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  30 
 
 
393 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  29.62 
 
 
403 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  29.95 
 
 
392 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  28.21 
 
 
419 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  29.62 
 
 
406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  29.19 
 
 
399 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  29.06 
 
 
383 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  28.1 
 
 
397 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  29.95 
 
 
402 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  29.87 
 
 
402 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  29.87 
 
 
402 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  29.44 
 
 
402 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  29.44 
 
 
371 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  29.19 
 
 
402 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  29.19 
 
 
402 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  26.34 
 
 
369 aa  146  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  29.68 
 
 
398 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  28.75 
 
 
383 aa  133  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  29.18 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  26.61 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  28.44 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  26.61 
 
 
369 aa  131  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  29.66 
 
 
383 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  26.2 
 
 
390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  25 
 
 
461 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  26.57 
 
 
384 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  29 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  27.49 
 
 
383 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  27.58 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  23.68 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.1 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  28.1 
 
 
366 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  26.4 
 
 
383 aa  109  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  27.25 
 
 
384 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.4 
 
 
365 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.4 
 
 
365 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  27.96 
 
 
367 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.13 
 
 
373 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  25.34 
 
 
362 aa  106  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.4 
 
 
365 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.68 
 
 
365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.4 
 
 
365 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  23.4 
 
 
365 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  23.4 
 
 
365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  23.4 
 
 
365 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  23.4 
 
 
365 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  27.49 
 
 
356 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  28.49 
 
 
366 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  25.95 
 
 
376 aa  103  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  24.86 
 
 
353 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  25.83 
 
 
380 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  25.83 
 
 
380 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  25.83 
 
 
380 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  23.39 
 
 
351 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  22.56 
 
 
365 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  25.54 
 
 
358 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  23.39 
 
 
351 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  25.4 
 
 
367 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  26.97 
 
 
369 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  23.84 
 
 
369 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  22.98 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  22.98 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.07 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24 
 
 
353 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  25.07 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  23.8 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24 
 
 
353 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  24.46 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  25.95 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  29.08 
 
 
382 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  22.59 
 
 
370 aa  97.4  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  28.53 
 
 
374 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  24.32 
 
 
351 aa  96.7  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  22.22 
 
 
356 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>