More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4378 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  80.61 
 
 
403 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  83.02 
 
 
371 aa  669    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  76.65 
 
 
402 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  77.89 
 
 
402 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  79.9 
 
 
406 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  78.7 
 
 
399 aa  669    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  77.89 
 
 
402 aa  638    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  100 
 
 
396 aa  821    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  78.41 
 
 
402 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  76.65 
 
 
402 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  77.89 
 
 
402 aa  638    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  69.31 
 
 
393 aa  578  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  69.49 
 
 
393 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  70.18 
 
 
393 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  68.8 
 
 
393 aa  575  1.0000000000000001e-163  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  68.72 
 
 
393 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  64.89 
 
 
392 aa  555  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  66.08 
 
 
419 aa  549  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  62.15 
 
 
395 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  57.47 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  48.19 
 
 
389 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  45.64 
 
 
393 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  46.41 
 
 
392 aa  378  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  45.64 
 
 
392 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  44.64 
 
 
392 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  45.04 
 
 
393 aa  349  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  43.73 
 
 
397 aa  346  5e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  30.65 
 
 
432 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  29.85 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  30.9 
 
 
418 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  29.57 
 
 
434 aa  176  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  30.02 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  31.69 
 
 
387 aa  168  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  28.54 
 
 
403 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  27.66 
 
 
397 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  24.83 
 
 
437 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  27.34 
 
 
383 aa  144  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  27.34 
 
 
383 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  27.79 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  28.53 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  27.18 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  28.35 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  26.9 
 
 
383 aa  140  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  30 
 
 
383 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  26.97 
 
 
394 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  27.11 
 
 
384 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  26.72 
 
 
394 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  27.92 
 
 
383 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  28.87 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  26.05 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  26.13 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  28.74 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  25.38 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.84 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  24.02 
 
 
369 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  27.48 
 
 
410 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  25.38 
 
 
373 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  25 
 
 
461 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  21.35 
 
 
356 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  22.25 
 
 
356 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  25.2 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  22.8 
 
 
356 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  21.99 
 
 
356 aa  96.3  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  21.91 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  21.73 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  25 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.65 
 
 
365 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  23.04 
 
 
353 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  23.32 
 
 
369 aa  94  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.45 
 
 
364 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  26.14 
 
 
374 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  21.65 
 
 
356 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  21.91 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  21.65 
 
 
356 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  23.65 
 
 
367 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  22.14 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  22.4 
 
 
358 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  23.39 
 
 
362 aa  92.8  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  27.52 
 
 
323 aa  92  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  22.54 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  25.88 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  22.6 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  22.34 
 
 
365 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  21.2 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  21.67 
 
 
361 aa  90.1  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  22.6 
 
 
365 aa  90.1  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  23.45 
 
 
369 aa  89.7  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  23.64 
 
 
347 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1159  peptidase M20  42.71 
 
 
171 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0202669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  22.34 
 
 
365 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  22.34 
 
 
365 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  24.48 
 
 
384 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  24.81 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  22.34 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  22.22 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1645  twin-arginine translocation pathway signal  23.85 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  23.89 
 
 
371 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  22.34 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  22.34 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  22.34 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>