More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4077 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  100 
 
 		 397 aa  826    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  71.87 
 
 		 393 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  47.45 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  46.94 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  46.58 
 
 		 392 aa  375  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  45.52 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  45.27 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  43.73 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  42.31 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  44.5 
 
 		 393 aa  349  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  44.36 
 
 		 403 aa  348  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  43.08 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  44.76 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  43.48 
 
 		 399 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  44.62 
 
 		 402 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  44.44 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  43.22 
 
 		 393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  43.59 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  43.59 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  43.05 
 
 		 371 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  43.08 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  43.08 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  43.08 
 
 		 402 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  42.13 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  40.82 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  40.51 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  36.39 
 
 		 389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  30.58 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  30.13 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  27.85 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  31.89 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  27.98 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  28.83 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  30.28 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  27.32 
 
 		 425 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  30.25 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  31.54 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  29.25 
 
 		 394 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  27.84 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  26.13 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  28.06 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  27.81 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  27.37 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  25.75 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  25.75 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  25.38 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  24.86 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  25.6 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  25.66 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  25.33 
 
 		 370 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.06 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  25.89 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  21.5 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  24.29 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  22.86 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  21.24 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  21.24 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  20.73 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  21.24 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  23.43 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  21.24 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  21.24 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  23.08 
 
 		 358 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  23.08 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  21.76 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  20.98 
 
 		 365 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  21.24 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1159  peptidase M20  44.44 
 
 		 171 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0202669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  22.51 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  23.45 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  20.68 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  20 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  20 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  24.29 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  24.48 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  23.58 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  22.81 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  26.58 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  24.69 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  21.61 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  24.47 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  22.48 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  24.81 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  23.43 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  23.93 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  27.01 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  22.45 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  26.89 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  21.2 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00854  putative metal-dependent dipeptidase  21.25 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  24.12 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  23.54 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1740  aminopeptidase P  26.23 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  21.45 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  24.49 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  25 
 
 		 364 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  20.1 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  23.39 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0992  peptidase M24  20.31 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.239876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>