More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2255 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  100 
 
 		 383 aa  792    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  82.94 
 
 		 383 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  82.94 
 
 		 383 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3174  proline dipeptidase  79.79 
 
 		 384 aa  594  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  69.29 
 
 		 383 aa  565  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  68.5 
 
 		 383 aa  564  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  69.55 
 
 		 383 aa  567  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2153  peptidase M24  69.82 
 
 		 383 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  49.74 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01582  conserved hypothetical protein  43.01 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  28.95 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3436  peptidase M24  33.43 
 
 		 397 aa  159  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0811  creatinase  30.3 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3859  peptidase M24  27.64 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3089  creatinase  32.84 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430642  normal  0.871573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2053  creatinase  32.25 
 
 		 394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61105  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3444  putative Xaa-Pro aminopeptidase  32.54 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  27.91 
 
 		 403 aa  143  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  28.99 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  29.04 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  28.94 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4112  creatinase  30.43 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  28.32 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4378  ectoine utilization protein EutD  30 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  29.56 
 
 		 392 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  29.66 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  27.07 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  27.76 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  29.92 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  27.64 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5807  peptidase M24  31.14 
 
 		 388 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.625105 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3467  ectoine utilization protein EutD  26.78 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  27.35 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3177  hypothetical protein  27.49 
 
 		 393 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  29.57 
 
 		 432 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2732  peptidase M24  27.59 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2149  peptidase M24  27.58 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3862  ectoine utilization protein EutD  27.16 
 
 		 403 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0063  putative peptidase  27.3 
 
 		 406 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00717092 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6143  ectoine utilization protein EutD  27.58 
 
 		 402 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  28.14 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1764  peptidase M24  29.59 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5803  peptidase M24  27.72 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6648  ectoine utilization protein EutD  27.72 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6167  peptidase M24  27.72 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5776  ectoine utilization protein EutD  27.76 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6020  peptidase M24  27.76 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4432  peptidase, M24 family protein  27.84 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2424  peptidase M24  28.83 
 
 		 410 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0172319 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1921  peptidase M24  26.3 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.927286  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2608  peptidase M24  25.4 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123707  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4077  creatinase  25.66 
 
 		 397 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2419  peptidase M24  26.58 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.704257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  23.43 
 
 		 356 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  23.43 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0948  peptidase M24  26.73 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.379402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  22.98 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  28.83 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  23.1 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  23.1 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  22.77 
 
 		 356 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  26.59 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.52 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  22.65 
 
 		 356 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  27.8 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  21.05 
 
 		 351 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  21.05 
 
 		 351 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  22.44 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  22.44 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  22.11 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  26.71 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  28.71 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  25.25 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  24.77 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  24.77 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  22.65 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  24.32 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  24.9 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2365  peptidase M24  28.57 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  25.07 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3496  creatinase  27.81 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289642  hitchhiker  0.00742078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2242  putative endopeptidase  24.71 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  24.03 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2132  putative endopeptidase  24.71 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  27.87 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2140  putative endopeptidase  24.71 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332227  normal  0.318783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.95 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.57 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.95 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.57 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  29.61 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.57 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.57 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.57 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0463  peptidase M24  23.33 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00525602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  23.3 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  23.3 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  24.48 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  23.79 
 
 		 357 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  23.75 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>