More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3838 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3765  peptidase M24  100 
 
 
422 aa  860    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2420  peptidase M24  91.47 
 
 
422 aa  787    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.903637  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3777  peptidase M24  99.76 
 
 
422 aa  859    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.312064  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3838  peptidase M24  100 
 
 
422 aa  860    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4232  peptidase M24  92.18 
 
 
422 aa  783    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  29.02 
 
 
369 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.92 
 
 
353 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.45 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  29.29 
 
 
348 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  26.97 
 
 
379 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  25.96 
 
 
363 aa  93.2  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.29 
 
 
353 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  27.96 
 
 
366 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  26.18 
 
 
433 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  31.14 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2365  peptidase M24  25.58 
 
 
400 aa  90.5  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  27.32 
 
 
393 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.29 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  27.11 
 
 
391 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  25.59 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  24.86 
 
 
351 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  28.01 
 
 
357 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  29.39 
 
 
357 aa  87  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  23.02 
 
 
355 aa  87  6e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  24.61 
 
 
359 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  26.15 
 
 
353 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  28.38 
 
 
448 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.9 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.58 
 
 
373 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.9 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  24.41 
 
 
353 aa  86.3  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  27.2 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  29.79 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.39 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  30.43 
 
 
353 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.2 
 
 
347 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  27.7 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  28.63 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  26.51 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  27.44 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  28.12 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  25 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  28.12 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  21.93 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  25.83 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.09 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  26 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  27.63 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  29.11 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  26.59 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  23.19 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3764  peptidase M24  25.13 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  26.13 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3837  peptidase M24  25.13 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  24.74 
 
 
357 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  29.39 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  24.6 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  26.57 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  24.13 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3776  peptidase M24  24.87 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367496  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0148  peptidase M24  24.12 
 
 
346 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.659547  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  20.38 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  20.38 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  24.21 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  26.84 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  28.11 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0624  peptidase/creatianse family protein  24.49 
 
 
357 aa  76.3  0.000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  26.92 
 
 
449 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0189  peptidase M24  23.28 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0275902  normal  0.05907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  27.71 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  27.71 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0463  peptidase M24  26.65 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00525602  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  28.11 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  29.24 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  22.63 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  22.63 
 
 
351 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  27.71 
 
 
361 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  27.71 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  27.69 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  23.58 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  27.71 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  26.42 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  26.09 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  25.12 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  26.8 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0731  peptidase M24  24.68 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000317312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3667  creatinase  23.38 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4231  peptidase M24  24.94 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  23.25 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  25.13 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  23.38 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  23.19 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0369  DNA polymerase III gamma and tau subunits  23.76 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000259471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0744  peptidase M24  26.21 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0725  peptidase M24  27.08 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00261455  normal  0.742968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>