More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2236 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3667  creatinase  93.05 
 
 		 403 aa  795    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  92.56 
 
 		 403 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  85.86 
 
 		 403 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  92.56 
 
 		 403 aa  788    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  100 
 
 		 403 aa  844    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  72.07 
 
 		 403 aa  617  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  66.91 
 
 		 419 aa  567  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1692  creatinase  63.96 
 
 		 408 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  63.96 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  62.38 
 
 		 418 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  61.81 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1018  creatinase  61.19 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  61.94 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  63.13 
 
 		 379 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  58.29 
 
 		 402 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  57.86 
 
 		 401 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  57.36 
 
 		 401 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  56.86 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  59.01 
 
 		 386 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.73 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.73 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.73 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.73 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  26.9 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.46 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  26.46 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  27.36 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  24.58 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  24.26 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.46 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.46 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  25.62 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.33 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  27.74 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  26.92 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  25.95 
 
 		 393 aa  100  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  25.25 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.14 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  28.12 
 
 		 448 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  25.44 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.81 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.41 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.14 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.14 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  25.47 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.14 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.14 
 
 		 353 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.14 
 
 		 353 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.14 
 
 		 353 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.14 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  24.88 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.33 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.72 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.06 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  24.69 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  25.98 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  23.94 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  28.83 
 
 		 348 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.34 
 
 		 348 aa  92  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  24.53 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.59 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  26.42 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  27.27 
 
 		 346 aa  91.3  3e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  24.86 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  25 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  28.52 
 
 		 347 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  26.6 
 
 		 356 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  27.66 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  26.63 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  26.77 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  23.59 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2855  peptidase M24  23.74 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  26.08 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  23.56 
 
 		 365 aa  87.4  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0287  peptidase M24  25.25 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.87112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  23.56 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  23.92 
 
 		 356 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  24.52 
 
 		 353 aa  87  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  23.91 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  23.76 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  22.61 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.42 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  23.24 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  25.39 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  22.57 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  24.1 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  24.1 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  28.17 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  25.07 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  22.87 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  23.93 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  27.21 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  24.68 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.82 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  27.6 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.82 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.73 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>