More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2498 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  93.25 
 
 
401 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  94 
 
 
401 aa  783    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  100 
 
 
401 aa  830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  73.12 
 
 
402 aa  622  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  74.74 
 
 
386 aa  612  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  56.86 
 
 
403 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3667  creatinase  57.11 
 
 
403 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  57.11 
 
 
403 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  58.08 
 
 
418 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  57.11 
 
 
403 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  58.19 
 
 
418 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  56.86 
 
 
403 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  57.22 
 
 
403 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  56.97 
 
 
419 aa  457  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1692  creatinase  56.36 
 
 
408 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1018  creatinase  56.38 
 
 
404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  56.1 
 
 
409 aa  453  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  57 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  56.65 
 
 
379 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  30.22 
 
 
347 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  28.38 
 
 
353 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  26.53 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.61 
 
 
353 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  29.38 
 
 
348 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  27.05 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.88 
 
 
353 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.61 
 
 
353 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.61 
 
 
353 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.61 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.88 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.61 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.61 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  29.07 
 
 
391 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.61 
 
 
353 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.37 
 
 
347 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  25.73 
 
 
353 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  25.86 
 
 
353 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.47 
 
 
365 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.27 
 
 
365 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.47 
 
 
365 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  26.33 
 
 
364 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.47 
 
 
365 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24 
 
 
365 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24 
 
 
365 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24 
 
 
365 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  25.37 
 
 
381 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.47 
 
 
365 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  23.73 
 
 
365 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  23.73 
 
 
365 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  28.61 
 
 
380 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  27.06 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  29.02 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  25.76 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  25.6 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  27.53 
 
 
367 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.66 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.18 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  29.3 
 
 
357 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.4 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  25.74 
 
 
400 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  23.99 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  23.99 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  23.99 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.46 
 
 
354 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  26.18 
 
 
355 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  27.84 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  27.13 
 
 
359 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  24.13 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  26.43 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  26.37 
 
 
361 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  26.37 
 
 
361 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  25.07 
 
 
361 aa  93.2  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  26.43 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  24.93 
 
 
353 aa  93.2  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  25.92 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.4 
 
 
356 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  24.4 
 
 
356 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  23.45 
 
 
356 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  23.72 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  25.92 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  25.92 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  24.34 
 
 
357 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  25.19 
 
 
361 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  26.6 
 
 
355 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  24.66 
 
 
364 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  27.4 
 
 
371 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  25.39 
 
 
361 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  24.38 
 
 
357 aa  89  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  26.85 
 
 
448 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  25.13 
 
 
361 aa  89.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  24.68 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  24.65 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  25.2 
 
 
359 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  23.25 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  24.54 
 
 
353 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  24.94 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5521  ectoine utilization protein EutD  25.45 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  24.8 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5242  ectoine utilization protein EutD  25.19 
 
 
393 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490883 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  25.14 
 
 
357 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>