More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3409 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1018  creatinase  99.74 
 
 		 404 aa  791    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  100 
 
 		 379 aa  792    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  83.42 
 
 		 410 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1692  creatinase  66.67 
 
 		 408 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  66.4 
 
 		 409 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  65.96 
 
 		 403 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3667  creatinase  63.13 
 
 		 403 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  63.13 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  66.93 
 
 		 403 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  63.2 
 
 		 403 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  63.13 
 
 		 403 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  62.66 
 
 		 419 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  60.1 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  58.78 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  57.33 
 
 		 418 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  56.65 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  56.65 
 
 		 401 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  56.38 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  56.42 
 
 		 386 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.2 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  25.99 
 
 		 353 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.53 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  23.8 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.53 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  23.53 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  23.53 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.53 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.73 
 
 		 365 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  27.21 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  26.4 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  24.5 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.26 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  22.99 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  23.26 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  23.26 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  25.9 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.62 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  26.29 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.62 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  25.92 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 		 353 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.34 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.34 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.34 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  26.23 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  25.82 
 
 		 357 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.07 
 
 		 353 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  22.46 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.07 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  26.55 
 
 		 400 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  24.12 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  26.74 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  23.86 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  28.4 
 
 		 361 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  28 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  28 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  28 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  25.98 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  28 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  25.34 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  26.88 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  27.24 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  25.34 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  27.64 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  28.16 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  27.24 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  26.78 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  26.88 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  27.24 
 
 		 356 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  27.2 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  26.88 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  27.2 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  21.77 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  26.88 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  26.8 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  26.88 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  26.53 
 
 		 369 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  23.13 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  25.6 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  27.11 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  25.26 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  23.35 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  25.89 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  26.1 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  21.86 
 
 		 351 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  26.52 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  26.16 
 
 		 356 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  23.72 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  26.96 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  22.79 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  23.81 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  22.22 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25.62 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  23.9 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  25.28 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3845  peptidase M24  25.96 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  23.55 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  23.4 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  23.92 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>