More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6284 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  100 
 
 
403 aa  839    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  73.32 
 
 
403 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  72.07 
 
 
403 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3667  creatinase  70.82 
 
 
403 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  70.82 
 
 
403 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  70.82 
 
 
403 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  66.75 
 
 
419 aa  549  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  63.79 
 
 
418 aa  538  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1692  creatinase  63.1 
 
 
408 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  63.1 
 
 
409 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  62.72 
 
 
418 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1018  creatinase  65.24 
 
 
404 aa  518  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  65.58 
 
 
410 aa  513  1e-144  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  66.93 
 
 
379 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  58.59 
 
 
401 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  57.93 
 
 
402 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  58.33 
 
 
401 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  58.44 
 
 
386 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  57.22 
 
 
401 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  26.5 
 
 
347 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  26.04 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  27.2 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  26.26 
 
 
393 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  26.2 
 
 
392 aa  106  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  28.02 
 
 
380 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  25.25 
 
 
400 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  23.39 
 
 
365 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.39 
 
 
365 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.39 
 
 
365 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  23.39 
 
 
365 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  23.39 
 
 
365 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.39 
 
 
365 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  23.39 
 
 
365 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  23.39 
 
 
365 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  25.64 
 
 
381 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  23.12 
 
 
365 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  26.95 
 
 
353 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  22.91 
 
 
365 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  29.41 
 
 
346 aa  100  6e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.37 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.37 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.37 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.37 
 
 
353 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  24.86 
 
 
388 aa  98.2  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.37 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  27.13 
 
 
353 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  26.2 
 
 
367 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  24.46 
 
 
353 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.1 
 
 
353 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  26.4 
 
 
448 aa  96.7  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  26.62 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.1 
 
 
353 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.83 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.1 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  24.94 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  24.69 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  25 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.35 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  27.92 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  25.07 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  21.83 
 
 
365 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  25.4 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  24.8 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  24.32 
 
 
354 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  23.69 
 
 
355 aa  90.9  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  23.75 
 
 
387 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  23.29 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.6 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  23.87 
 
 
369 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  24.03 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  22.08 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  24.26 
 
 
362 aa  87  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  23.77 
 
 
361 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  23.77 
 
 
361 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  25.93 
 
 
353 aa  86.3  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  23.44 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  22.07 
 
 
357 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  24 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  23.77 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  23.36 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  25.54 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  21.98 
 
 
364 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  23.92 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  23.77 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  24.94 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2694  peptidase M24  24.62 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.33 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  26.09 
 
 
348 aa  84  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  24.15 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  23.16 
 
 
356 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  26.27 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3845  peptidase M24  24.3 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1099  peptidase M24  23.96 
 
 
356 aa  83.2  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  23.2 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  22.11 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  22.85 
 
 
356 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  23.16 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  23.63 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  21.95 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  21.86 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>