More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0398 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  93.25 
 
 
401 aa  778    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  98.75 
 
 
401 aa  819    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  100 
 
 
401 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  71.93 
 
 
402 aa  608  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  75.06 
 
 
386 aa  607  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  58.1 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  58.35 
 
 
403 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3667  creatinase  58.35 
 
 
403 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  58.35 
 
 
403 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  58.69 
 
 
418 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  57.86 
 
 
403 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  58.44 
 
 
418 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  58.33 
 
 
403 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  57.96 
 
 
419 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1018  creatinase  56.38 
 
 
404 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1692  creatinase  55.64 
 
 
408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  57.51 
 
 
410 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  55.38 
 
 
409 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  56.65 
 
 
379 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  27.49 
 
 
400 aa  123  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  26.37 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  29.67 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  28.84 
 
 
348 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  25.61 
 
 
353 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  27.51 
 
 
353 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  25.88 
 
 
353 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.61 
 
 
353 aa  106  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  27.82 
 
 
347 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  24.4 
 
 
365 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.34 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  29.62 
 
 
380 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.61 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 
353 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.34 
 
 
353 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.34 
 
 
353 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 
353 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  25.34 
 
 
353 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.34 
 
 
353 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.94 
 
 
365 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.4 
 
 
365 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  24.4 
 
 
365 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  24.4 
 
 
365 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  24.4 
 
 
365 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  24.4 
 
 
365 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  27.53 
 
 
391 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  25.07 
 
 
364 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  26.93 
 
 
387 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  25.54 
 
 
353 aa  99.8  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  25.48 
 
 
355 aa  99.8  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  23.4 
 
 
365 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  24.14 
 
 
365 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  24.14 
 
 
365 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  23.14 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  27.46 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  24.93 
 
 
353 aa  96.7  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  28.21 
 
 
357 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  27.44 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  26.37 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  26.81 
 
 
355 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.11 
 
 
356 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  26.81 
 
 
359 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  25.36 
 
 
361 aa  93.6  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.11 
 
 
356 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.8 
 
 
356 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.26 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.26 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.26 
 
 
356 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  23.56 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  23.84 
 
 
356 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  23.8 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  23.97 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  27.25 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  27.34 
 
 
357 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  24.26 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  23.71 
 
 
356 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  26.53 
 
 
384 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  23.81 
 
 
357 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  22.81 
 
 
351 aa  89.7  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  22.81 
 
 
352 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  26.11 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  25.45 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  24.13 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  26.11 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  25.99 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  26.11 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  26.1 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1596  peptidase M24  25.65 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  23.18 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  26.11 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  26.11 
 
 
361 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.26 
 
 
367 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  28.65 
 
 
365 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  24.73 
 
 
359 aa  86.3  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  27.44 
 
 
357 aa  86.3  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  27.15 
 
 
361 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  25.59 
 
 
361 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  28.2 
 
 
378 aa  86.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  25.33 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  24.86 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  23.59 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>