More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3269 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3667  creatinase  85.61 
 
 		 403 aa  749    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.817238  normal  0.0812938 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3269  peptidase M24  100 
 
 		 403 aa  846    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2062  creatinase  85.36 
 
 		 403 aa  746    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2236  creatinase  85.86 
 
 		 403 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2232  creatinase  85.11 
 
 		 403 aa  741    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.778735  normal  0.504601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  73.32 
 
 		 403 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0461  creatinase  68.15 
 
 		 419 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1692  creatinase  66.5 
 
 		 408 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1738  creatinase  66.5 
 
 		 409 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  62.62 
 
 		 418 aa  537  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1018  creatinase  64.25 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  62.91 
 
 		 418 aa  531  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3409  creatinase  65.96 
 
 		 379 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2126  creatinase  65.84 
 
 		 410 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2491  creatinase  59.8 
 
 		 402 aa  501  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.57108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  57.61 
 
 		 401 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  58.1 
 
 		 401 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2612  peptidase M24  59.53 
 
 		 386 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2498  peptidase M24  56.86 
 
 		 401 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7796  peptidase M24  28.64 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.61 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.61 
 
 		 365 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.81 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  25.34 
 
 		 365 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  25.07 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4151  peptidase M24  25.69 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  25.14 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  25.07 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  25.07 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  25.27 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  25.53 
 
 		 347 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  29.02 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3170  peptidase M24  25 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  27.06 
 
 		 448 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2943  creatinase  26.14 
 
 		 392 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  26.22 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.76 
 
 		 353 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  26.29 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  25.95 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  25.27 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  25.38 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4051  peptidase M24  31.52 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.505209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2963  peptidase M24  24.94 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276941  normal  0.579092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25.95 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.95 
 
 		 353 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.27 
 
 		 357 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  25.68 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  26.26 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  25.68 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  25.68 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  25.68 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  25.68 
 
 		 353 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  25.07 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.45 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.53 
 
 		 364 aa  94.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  24.66 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1051  creatinase  24.94 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  24.8 
 
 		 369 aa  94  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  26.22 
 
 		 351 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  26.22 
 
 		 351 aa  93.2  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  25.77 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  23.77 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  25.26 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  25.53 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  25.4 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  24.88 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.18 
 
 		 356 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  25.12 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  27.37 
 
 		 346 aa  90.9  4e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  25.82 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  25.95 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.32 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.32 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  24.32 
 
 		 356 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0543  Mername-AA019 peptidase  22.76 
 
 		 365 aa  89.7  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  24.84 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  24.19 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  23.24 
 
 		 353 aa  88.2  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  23.43 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  25.2 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  25.31 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  24.6 
 
 		 356 aa  86.7  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  24.07 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  27.2 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  21.51 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  24.8 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  23.4 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  23.31 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  25 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  24.06 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  23.23 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  22.68 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  24.32 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  26.8 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  26.8 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  27.2 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  24.18 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>