More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0108 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  97.16 
 
 		 388 aa  785    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  100 
 
 		 388 aa  802    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  79.9 
 
 		 388 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  57.07 
 
 		 393 aa  461  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  56.92 
 
 		 393 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1829  peptidase M24  43.98 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2710  peptidase M24  44.56 
 
 		 387 aa  294  1e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529635  normal  0.905643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  29.09 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  29.09 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  31.15 
 
 		 386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  34.85 
 
 		 357 aa  129  8.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  31.21 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  28.26 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  28.83 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  28.81 
 
 		 376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  28.26 
 
 		 351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  29.71 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5327  peptidase M24  29.49 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.445473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  29.18 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  27.51 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  28.53 
 
 		 359 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  28.91 
 
 		 356 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  28.19 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  28.65 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  28.65 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1765  creatinase  25.25 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  28.46 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  28.65 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  28.3 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  28.65 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  28.65 
 
 		 356 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  29.82 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  28.65 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  28.65 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  29.27 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  29.27 
 
 		 365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  29 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  29 
 
 		 365 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  30.11 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  29 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  30.97 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  26.42 
 
 		 376 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  29 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  26.76 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  29 
 
 		 365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  28.96 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  28.81 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  33.09 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  27.44 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  28.73 
 
 		 365 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  32.22 
 
 		 357 aa  116  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  25.47 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  28.53 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  28.46 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  29.87 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5851  peptidase M24  28.12 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.844746 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  26.54 
 
 		 360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1459  M24 family metallopeptidase  27.37 
 
 		 409 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1028  peptidase M24  27.76 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000479097  normal  0.388607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.32 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.91 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  32.94 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.64 
 
 		 353 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  28.23 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  24.81 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  27.6 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.91 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.91 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.91 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.64 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  26.32 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  32.53 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2067  peptidase M24  30.48 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  26.65 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.91 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0955  peptidase M24  28.12 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0458014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  32.13 
 
 		 353 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  32.45 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  30.31 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0922  peptidase M24  27.42 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.565676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  27.52 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  27.52 
 
 		 353 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  28.91 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  32.77 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  32.77 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3217  peptidase M24  26.65 
 
 		 353 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  32.75 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  35.47 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7500  peptidase M24  26.14 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137985  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  33.19 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  33.19 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  31.49 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  33.19 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  26.36 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  26.1 
 
 		 373 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  29.58 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  27.11 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  26.42 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  29.35 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>