More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7500 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7500  peptidase M24  100 
 
 
398 aa  821    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.137985  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2026  peptidase M24  27.16 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.442102  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0108  peptidase M24  26.14 
 
 
388 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4077  peptidase M24  25.63 
 
 
388 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  24.87 
 
 
393 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  26.28 
 
 
393 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1829  peptidase M24  25.58 
 
 
385 aa  93.6  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  26.37 
 
 
353 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.27 
 
 
356 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2751  peptidase M24  28.97 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  24.93 
 
 
354 aa  89.4  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  30.17 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0940  peptidase M24  24.8 
 
 
353 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  28.3 
 
 
359 aa  84.3  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  29.34 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  26.34 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.89 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  29.34 
 
 
353 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  24.46 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  27.92 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  25.91 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  28.74 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  28.33 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  25.21 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  25.16 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  25.52 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  30 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  25.85 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  28.16 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2710  peptidase M24  24.23 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529635  normal  0.905643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2174  peptidase M24  29.87 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0841852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  26.7 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0889  M24 family peptidase  27.41 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  29.53 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf338  Xaa-Pro aminopeptidase  31.6 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0464176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  29.53 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  27.23 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  29.53 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  29.53 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  29.53 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  25.96 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  29.53 
 
 
361 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  29.53 
 
 
361 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  27.9 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  26.47 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  28.98 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  26.58 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  24.8 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0666  peptidase M24  28.57 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  25.98 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1905  peptidase M24  26.67 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0678501 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24.27 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  25.33 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24.27 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  29.13 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  24.1 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  26.86 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  29.44 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  26.86 
 
 
356 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  23.34 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  25.37 
 
 
373 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1724  peptidase M24  25.35 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0292375 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  28.63 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  27.46 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  31.62 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3060  peptidase M24  26.92 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  27.47 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  27.85 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  27.47 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  27.11 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0188  proline dipeptidase  23.29 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  26.5 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0663  peptidase M24  27.23 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0285  peptidase M24  25.65 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  26.46 
 
 
357 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  27.8 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  28.88 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0164  peptidase M24  23.43 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  29.79 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  29.3 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  24.57 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  26.56 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  28.38 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  28.38 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  31.25 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2694  peptidase M24  24.43 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  23.04 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3488  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  24.86 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  27.56 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0189  peptidase M24  25 
 
 
351 aa  72.8  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0275902  normal  0.05907 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0959  aminopeptidase P  28.51 
 
 
362 aa  72.8  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00122435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  24.42 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>