More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4994 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5853  peptidase M24  81.06 
 
 
395 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.183484  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4994  peptidase M24  100 
 
 
396 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1454  peptidase M24  45.79 
 
 
384 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  27.98 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  26.84 
 
 
399 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  25.79 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0766  peptidase M24  28.13 
 
 
364 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  29 
 
 
347 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2697  peptidase M24  24.93 
 
 
364 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2712  peptidase M24  29.23 
 
 
367 aa  94  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  27.9 
 
 
347 aa  93.2  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0663  peptidase M24  27.01 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  26.8 
 
 
373 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  29.46 
 
 
376 aa  89.7  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  28.57 
 
 
355 aa  89.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6121  peptidase M24  26.72 
 
 
448 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  26.18 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  28.41 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  28.73 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2048  peptidase M24  26.23 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  27.01 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  29.78 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  26.96 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  27.73 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  30.99 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  30.99 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  30.99 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  28.49 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  24.55 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  21.81 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2242  putative endopeptidase  24.25 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2132  putative endopeptidase  24.25 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  24.61 
 
 
372 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  21.81 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  26.43 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  24.08 
 
 
353 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  31.3 
 
 
362 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  25 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  28.36 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  24.74 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  24.42 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  24.42 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  23.67 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  24.42 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  28.91 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  27.38 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  25.52 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  24.16 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  29.13 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  25.1 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2140  putative endopeptidase  24 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332227  normal  0.318783 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  24.55 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  24.21 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0984  peptidase M24  27.48 
 
 
390 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  24.16 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0843  peptidase M24  25.64 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58375  metallopeptidase  25 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.707436  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  28.36 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  24.8 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  26.23 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  21.68 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  29.12 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  30.2 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  27.97 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  20.65 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  25.82 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1137  peptidase M24  33.54 
 
 
359 aa  77  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850541 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  20.65 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.22 
 
 
365 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0706  proline dipeptidase  25.81 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.050337  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  30.5 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  22.96 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  22.96 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  22.96 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  23.22 
 
 
365 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  23.22 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  27.17 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  22.96 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2005  peptidase M24  25.65 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  31.62 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  26.81 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  22.96 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5355  proline dipeptidase  25.84 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.541955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2024  peptidase M24  27.65 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.711973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  22.46 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  23.93 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  25.83 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  22.69 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  22.51 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  22.51 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  28.39 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1062  proline dipeptidase  25.09 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0450472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  27.23 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0688  peptidase M24  28.72 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1321  peptidase M24  28.57 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01522  putative metal-dependent dipeptidase  26.21 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  24.28 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  25.28 
 
 
380 aa  72.8  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0863  proline dipeptidase  28.39 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  23.53 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>