177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0284 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  920    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2937  protein of unknown function DUF815  40 
 
 		 485 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000616511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1586  protein of unknown function DUF815  42.44 
 
 		 440 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2317  hypothetical protein  38.49 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0244932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1080  protein of unknown function DUF815  36.61 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1109  hypothetical protein  38.34 
 
 		 435 aa  299  7e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2854  hypothetical protein  38.33 
 
 		 447 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0399662  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3304  protein of unknown function DUF815  36 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2796  protein of unknown function DUF815  36 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3284  protein of unknown function DUF815  36.9 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0393  hypothetical protein  35.96 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.467349 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  38.56 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4062  hypothetical protein  35.76 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3290  protein of unknown function DUF815  36.85 
 
 		 423 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0255  ATPase  35.96 
 
 		 426 aa  277  3e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1386  hypothetical protein  34.32 
 
 		 442 aa  268  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.187879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15640  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  47.62 
 
 		 436 aa  266  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3420  protein of unknown function DUF815  49.25 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358176  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1700  hypothetical protein  35.19 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0900  hypothetical protein  34.24 
 
 		 465 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417212  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1275  hypothetical protein  45.36 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0212  hypothetical protein  34.66 
 
 		 465 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2014  protein of unknown function DUF815  32.63 
 
 		 392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  40.86 
 
 		 297 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  45.91 
 
 		 296 aa  212  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  42.75 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  42.46 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  42.08 
 
 		 297 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  43.44 
 
 		 291 aa  196  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  44.05 
 
 		 288 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3174  protein of unknown function DUF815  41.09 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  43.81 
 
 		 296 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  40.75 
 
 		 296 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  43.1 
 
 		 296 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  38.7 
 
 		 294 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2779  hypothetical protein  39.92 
 
 		 325 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548946  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  39.04 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  43.78 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2778  hypothetical protein  40.7 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118692  normal  0.524197 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1797  hypothetical protein  39.47 
 
 		 320 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  42.68 
 
 		 295 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  42.26 
 
 		 295 aa  190  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2734  hypothetical protein  40.08 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333936  normal  0.444885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2231  hypothetical protein  39.11 
 
 		 291 aa  189  9e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.306795  normal  0.283109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  40 
 
 		 296 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  42.62 
 
 		 295 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  42.62 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  44.3 
 
 		 294 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  43.75 
 
 		 292 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  43.75 
 
 		 292 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  42.99 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4247  hypothetical protein  39.02 
 
 		 298 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1771  hypothetical protein  39.31 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.338358  decreased coverage  0.00439264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  41.37 
 
 		 299 aa  187  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  44.3 
 
 		 294 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  43.86 
 
 		 294 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0817  protein of unknown function DUF815  41.22 
 
 		 287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0668  hypothetical protein  41.22 
 
 		 287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  44.2 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  41.67 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  41.42 
 
 		 285 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  42.63 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  42.51 
 
 		 325 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  44.2 
 
 		 303 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1731  protein of unknown function DUF815  38.17 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1465  protein of unknown function DUF815  37.94 
 
 		 273 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000978175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  42.74 
 
 		 293 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  43.05 
 
 		 291 aa  184  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1183  hypothetical protein  39.22 
 
 		 289 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  43.65 
 
 		 289 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.416063  normal  0.735551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  39.76 
 
 		 284 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  42.98 
 
 		 298 aa  183  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  43.65 
 
 		 289 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  43.65 
 
 		 289 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  41.77 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  42.31 
 
 		 300 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4408  putative ATPase family protein  38.76 
 
 		 306 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  42.74 
 
 		 291 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  43.25 
 
 		 289 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  40.32 
 
 		 296 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  43.43 
 
 		 289 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  42.86 
 
 		 300 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  42.22 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0999  hypothetical protein  38.37 
 
 		 307 aa  180  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.304861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3034  hypothetical protein  39.53 
 
 		 304 aa  179  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2542  ATPase  38.55 
 
 		 279 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  41.18 
 
 		 290 aa  179  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  40.46 
 
 		 297 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1202  hypothetical protein  38.55 
 
 		 279 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3938  protein of unknown function DUF815  40.32 
 
 		 297 aa  179  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00359477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1766  hypothetical protein  38.22 
 
 		 296 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3854  protein of unknown function DUF815  40.32 
 
 		 297 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.256346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  39.92 
 
 		 259 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1346  protein of unknown function DUF815  37.35 
 
 		 283 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.225611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  42.79 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2488  hypothetical protein  36.72 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2571  hypothetical protein  40.68 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0765647  normal  0.682441 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  42.34 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>