162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1275 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  896    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00110439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3420  protein of unknown function DUF815  51.15 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15640  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  39.58 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1109  hypothetical protein  39.09 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2317  hypothetical protein  31.8 
 
 		 474 aa  256  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0244932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2937  protein of unknown function DUF815  33.62 
 
 		 485 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000616511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0091  hypothetical protein  35.68 
 
 		 430 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0284  hypothetical protein  45.36 
 
 		 452 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0900  hypothetical protein  34.79 
 
 		 465 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417212  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1700  hypothetical protein  34.51 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1586  protein of unknown function DUF815  36.09 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2796  protein of unknown function DUF815  33.49 
 
 		 428 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3304  protein of unknown function DUF815  33.49 
 
 		 428 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.452837 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0212  hypothetical protein  35.04 
 
 		 465 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3284  protein of unknown function DUF815  33.62 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4062  hypothetical protein  36.41 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2854  hypothetical protein  44.32 
 
 		 447 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0399662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3290  protein of unknown function DUF815  35.33 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0393  hypothetical protein  43.41 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.467349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0255  ATPase  32.04 
 
 		 426 aa  209  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1080  protein of unknown function DUF815  33.7 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1765  hypothetical protein  40.4 
 
 		 296 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0416828 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2014  protein of unknown function DUF815  41.11 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1386  hypothetical protein  42.86 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.187879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2054  hypothetical protein  43.15 
 
 		 297 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0883112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3611  hypothetical protein  40.91 
 
 		 296 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.715293  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1438  hypothetical protein  40.25 
 
 		 292 aa  187  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1783  hypothetical protein  41 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2832  hypothetical protein  43.59 
 
 		 294 aa  186  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.348034  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3077  protein of unknown function DUF815  44.44 
 
 		 294 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2712  protein of unknown function DUF815  43.59 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3364  hypothetical protein  39.83 
 
 		 299 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.897739 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1227  hypothetical protein  43.04 
 
 		 253 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3705  hypothetical protein  42.15 
 
 		 296 aa  182  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2043  protein of unknown function DUF815  41.3 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153285  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0639  hypothetical protein  43.04 
 
 		 253 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.486807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3660  protein of unknown function DUF815  41.63 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.703558  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0798  hypothetical protein  41.56 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257251  normal  0.35486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2332  hypothetical protein  38.82 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.389695  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0761  protein of unknown function DUF815  41.56 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2123  hypothetical protein  38.52 
 
 		 294 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848786  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1102  hypothetical protein  43.04 
 
 		 253 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.83556  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1239  hypothetical protein  39 
 
 		 297 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.829737  normal  0.0705082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2175  protein of unknown function DUF815  41.08 
 
 		 295 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27560  hypothetical protein  37.8 
 
 		 296 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.818551  decreased coverage  0.00239701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2113  hypothetical protein  36.49 
 
 		 296 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.604292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0543  hypothetical protein  41.6 
 
 		 310 aa  180  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0502  AAA ATPase family protein  41.88 
 
 		 303 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4230  protein of unknown function DUF815  40.26 
 
 		 291 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0216148  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3926  hypothetical protein  41.08 
 
 		 300 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0270172  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2947  protein of unknown function DUF815  41.03 
 
 		 300 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.600856  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1451  hypothetical protein  38.67 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1583  hypothetical protein  40.93 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.308519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3839  hypothetical protein  38.67 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146112  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2968  hypothetical protein  40.6 
 
 		 298 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1876  hypothetical protein  38.67 
 
 		 348 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  0.342495 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2538  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5495  hypothetical protein  41.45 
 
 		 318 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428954  normal  0.220508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1129  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3687  hypothetical protein  41.13 
 
 		 290 aa  176  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0460  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.683593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1318  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3513  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3538  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3244  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0715  ABC transporter ATPase  39.83 
 
 		 254 aa  176  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0689546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1485  hypothetical protein  38.49 
 
 		 295 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3978  hypothetical protein  39.06 
 
 		 296 aa  176  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2860  hypothetical protein  38.53 
 
 		 289 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0853039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0180  hypothetical protein  40.08 
 
 		 285 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.617171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3656  hypothetical protein  40.33 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.248757  normal  0.484946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0474  hypothetical protein  40.33 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0499  hypothetical protein  40.33 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1644  hypothetical protein  41.88 
 
 		 294 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00331204  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0079  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 		 254 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.895882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2662  hypothetical protein  41.87 
 
 		 289 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2909  hypothetical protein  41.13 
 
 		 292 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0541  hypothetical protein  39.92 
 
 		 289 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.335372  normal  0.0868506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1008  hypothetical protein  41.39 
 
 		 299 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3017  protein of unknown function DUF815  40 
 
 		 297 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.912853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1912  hypothetical protein  38.89 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134898  normal  0.72221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0089  hypothetical protein  39.92 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0571  hypothetical protein  39.92 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0740  hypothetical protein  40.98 
 
 		 293 aa  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1795  hypothetical protein  40.24 
 
 		 284 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680699  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6886  hypothetical protein  39.57 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.231048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0830  hypothetical protein  40.66 
 
 		 291 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0214  hypothetical protein  40.6 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.752767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1650  hypothetical protein  38.43 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3688  hypothetical protein  41.3 
 
 		 259 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3124  protein of unknown function DUF815  39.57 
 
 		 297 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.561403  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2825  hypothetical protein  39.51 
 
 		 289 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0497  ATP/GTP-binding protein  39.09 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3459  protein of unknown function DUF815  39.09 
 
 		 296 aa  170  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394116  hitchhiker  0.000152293 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2931  hypothetical protein  38.89 
 
 		 296 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15470  hypothetical protein  36.8 
 
 		 293 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1443  hypothetical protein  41.13 
 
 		 288 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0616469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2616  protein of unknown function DUF815  40.85 
 
 		 294 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000541258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0291  hypothetical protein  36.36 
 
 		 290 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0751  hypothetical protein  39.57 
 
 		 296 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00011277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>